Předmět: Biostatistika

« Zpět
Název předmětu Biostatistika
Kód předmětu BOT/BSTSB
Organizační forma výuky Přednáška + Cvičení
Úroveň předmětu Bakalářský
Rok studia nespecifikován
Semestr Zimní
Počet ECTS kreditů 5
Vyučovací jazyk Čeština
Statut předmětu Povinný, Povinně-volitelný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Duchoslav Martin, RNDr. Ph.D.
Obsah předmětu
Cílem kurzu je seznámit studenty se základními principy statistického uvažování a s jejich aplikací v biologii a ekologii. Přednáška je zaměřena na pochopení principů a aplikaci statistických metod a na správnou interpretaci výsledků statistických testů. Absolvent kurzu by měl být schopen správně navrhnout experiment či pozorování, správně data sebrat, zpracovat a interpretovat, ať už pro účely bakalářské nebo magisterské práce. Při studiu odborné literatury ve svém oboru by měl student po absolvování tohoto kurzu pochopit význam statistického hodnocení a velké části použitých statistických metod v příslušném textu. Problémy a použité statistické testy jsou demonstrovány na biologických a ekologických příkladech. Součástí kurzu je i cvičení, určené k praktickému procvičování příkladů za pomoci statistických programových balíků. Pozornost bude zaměřena na vkládání a editaci dat, jednoduché grafické zobrazování a základní logické, třídící a statistické operace v programu MS Excel for Windows, a dále na základní a některé pokročilejší statistické procedury v programovacím prostředí jazyka R. Sylabus 1. Úvod, základní pojmy, co je věda, metodologie, filozofie vědy, deduktivní a induktivní uvažování 2. Základní soubor a výběr, experiment vs. pozorování, design sběru dat a experimentu, typy proměnných, deskriptivní statistika, grafická presentace dat 3. Pravděpodobnost, distribuční funkce, teoretické modely rozdělení pravděpodobností, principy testování statistických hypotéz 3. Analýza kategoriálních dat (test dobré shody, kontingenční tabulky, Fisherův exaktní test, odds ratio, log-lineární modely) 3. Analýza ordinálních a spojitých dat I: jeden a dva soubory, parametrické a neparametrické testy (Monte Carlo), náhodné a blokové uspořádání pokusu, testování normality dat, transformace dat 4. Analýza ordinálních a spojitých dat II: tři a více souborů - ANOVA: jednoduchá, vícefaktorová, se znáhodněnými bloky, s opakovanými měřeními, hierarchická, design pokusu 5. Vztah dvou (ordinálních) kvantitativních proměnných: regrese a korelace, lineární a nelineární modely, ANCOVA, parametrická a neparametrická korelace

Studijní aktivity a metody výuky
Přednášení, Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Projekce (statická, dynamická), Laborování
Výstupy z učení
Současné biologické a ekologické vědy jsou kvantitativní vědy. Informace (čísla), které záskávají, jsou však zatíženy náhodnou variabilitou, resp. získaná data obsahují náhodnou složku. Statistika nám dává návod, jak s takovými daty pracovat a jak odlišit zákonitosti od náhodné variability. Cílem kurzu je seznámit studenty se základními principy statistických aplikací v biologii a ekologii, a to jak teoreticky (pochopení principu metod a jak je správně a nesprávně použít), tak prakticky (cvičení se statistickým software na zpracování a analýzu dat).
Po absolvování kurzu by student měl být schopen: - navrhnout design experimentu či pozorování a správně sebrat data - vysvětlit principy a aplikaci statistických metod a správně interpretovat výsledky statistických testů - zpracovat data a vyhodnotit je vhodnými statistickými programy (R)
Předpoklady
nespecifikováno

Hodnoticí metody a kritéria
Známkou, Ústní zkouška, Písemná zkouška

kombinovaná zkouška v rozsahu probírané látky: písemný test z teorie, řešení příkladů na PC v prostředí jazyka R, diskuse nad odborným cizojazyčným článkem
Doporučená literatura
  • Delventhal K. a kol. (2004). Kompendium matematiky.-. Universum.
  • Gotelli N., Ellison A. (2004). A Primer of Ecological Statistics.-. Sinauer Associates.
  • Hendl, J. (2006). Přehled statistických metod: analýza a metaanalýza dat. 4., rozš. vyd. Praha: Portál, 2012.. Portál, Praha.
  • Lepš J. & Šmilauer P. (2016). Biostatistika. České Budějovice.
  • Meloun M. & Militký J. (2002). Kompendium statistického zpracování dat.. Academia, Praha.
  • Moore D. S. (2007). The basic practice of statistics.-. Freeman, New York.
  • Quinn G.P. & Keough M.J. (2002). Experimental design and data analysis for biologist.-. Cambridge University Press.
  • Sokal R. & Rohlf F. (1995). Biometry.-. Freeman and Company, New York.
  • Zar J. H. (1998). Biostatistical analysis.-. Prentice Hall, Englewood Cliffs.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Molekulární a buněčná biologie (2021) Kategorie: Biologické obory 1 Doporučený ročník:1, Doporučený semestr: Zimní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Ekologie a ochrana životního prostředí (2021) Kategorie: Ekologie a ochrana životního prostředí 3 Doporučený ročník:3, Doporučený semestr: Zimní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biotechnologie a genové inženýrství (2022) Kategorie: Chemické obory 2 Doporučený ročník:2, Doporučený semestr: Zimní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biofyzika - specializace Obecná biofyzika (2024) Kategorie: Fyzikální obory 3 Doporučený ročník:3, Doporučený semestr: Zimní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biologie a ekologie (2020) Kategorie: Biologické obory 3 Doporučený ročník:3, Doporučený semestr: Zimní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biologie pro vzdělávání maior (2019) Kategorie: Biologické obory 2 Doporučený ročník:2, Doporučený semestr: Zimní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biofyzika - specializace Molekulární biofyzika (2024) Kategorie: Fyzikální obory 3 Doporučený ročník:3, Doporučený semestr: Zimní