Předmět: Analýza kompozičních dat v kinantropologii

« Zpět
Název předmětu Analýza kompozičních dat v kinantropologii
Kód předmětu KMA/PGKIN
Organizační forma výuky Přednáška + Cvičení
Úroveň předmětu nespecifikována
Rok studia nespecifikován
Semestr Letní
Počet ECTS kreditů 5
Vyučovací jazyk Čeština
Statut předmětu nespecifikováno
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Hron Karel, prof. RNDr. Ph.D.
Obsah předmětu
1. Výběrový prostor, kompoziční data jako metodický koncept 2. Geometrické vlastnosti kompozičních dat 3. Průzkumová analýza dat a vizualizace 4. Mnohorozměrná statistika s kompozičními daty: shluková analýza, PCA, korelační analýza, klasifikace 5. Regresní analýza 6. Metody pro vysoce-dimenzionální kompoziční data 7. Kompoziční tabulky 8. Předzpracování kompozičních dat (nuly a chybějící hodnoty) 9. Bayesovy prostory: nástroj pro analýzu hustot rozdělení pravděpodobnosti

Studijní aktivity a metody výuky
Přednášení, Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming)
  • Příprava na zkoušku - 40 hodin za semestr
Výstupy z učení
Cílem předmětu je představit logpodílovou metodiku pro statistickou analýzu kompozičních dat. Klíčové pojmy budou ilustrovány s využitím reálných dat týkajících se relativní struktury 24hod pohybového chování (tj., spánek, sedavé chování a pohybová aktivita).
Aplikace Aplikace statistické analýzy kompozičních dat v kiantropologii.
Předpoklady
Znalosti ze základního kurzu aplikované statistiky.

Hodnoticí metody a kritéria
Ústní zkouška

Ústní zkouška: porozumět klíčovým pojmům a metodám statistické analýzy kompozičních dat + provést ucelenou analýzu dat z oblasti kinantropologie.
Doporučená literatura
  • A. Buccianti, V. Pawlowsky-Glahn. (2011). Compositional data analysis: Theory and applications. Wiley, Chichester.
  • Dumuid, D., Pedisic, Z., Stanford, T.E., Martín-Fernández, J.A., Hron, K., Maher, C., Lewis, L.K., Olds, T.S. (2019). The compositional isotemporal substitution model: a method for estimating changes in a health outcome for reallocation of time between sleep, physical activity, and sedentary behaviour. Statistical Methods in Medical Research, 28 (3), 846-857.
  • Dumuid, D., Stanford, T.E., Olds, T., Lewis, L.K., Martín-Fernández, J.A., Pedisic, Z., Hron, K., Katzmarzyk, P.T., Barreira, T., Broyles, S.T., Chaput, J.P., Fogelholm, M., Hu, G., Lambert, E.V., Maia, J., Sarmiento, O.L., Standage, M., Tremblay, M.S., Tudor-Locke, C., Maher, C. (2018). Compositional data analysis for physical activity, sedentary time and sleep research. Statistical Methods in Medical Research, 27 (12), 3726-3738.
  • J. Aitchison. (1986). The statistical analysis of compositional data. Chapman and Hall, London.
  • K.G. van den Boogaart, R. Tolosana-Delgado. (2013). Analyzing compositional data with R. Springer, Heidelberg.
  • P. Filzmoser, K. Hron, M. Templ. (2018). Applied compositional data analysis. Springer, Cham.
  • V. Pawlowsky-Glahn, J.J. Egozcue, R. Tolosana-Delgado. (2015). Modeling and analysis of compositional data. Wiley, Chichester.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr