Předmět: Mikrofotografie a analýza obrazu v biologii

« Zpět
Název předmětu Mikrofotografie a analýza obrazu v biologii
Kód předmětu KEB/MIKAN
Organizační forma výuky Přednáška + Seminář
Úroveň předmětu Bakalářský
Rok studia 2
Semestr Zimní
Počet ECTS kreditů 4
Vyučovací jazyk Čeština
Statut předmětu Povinně-volitelný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Mistrík Martin, Mgr. Ph.D.
  • Überall Ivo, Ing. Ph.D.
Obsah předmětu
Způsoby pořizování obrazových dat v biologii a využití analýzy obrazu. Zahrnuje současná dokumentační zařízení, klasické a digitální fotoaparáty, TV a digitální kamery, digitalizace signálu. Makrofotografie a mikrofotografie. Základy počítačové grafiky, software a hardware. Pořizování a archivace obrazových dat, principy manuálního a automatického měření biologických objektů. Předzpracování a zpracování obrazu. Praktická výuka zpracování obrazových dat pomocí Matlabu. Praktické ukázky využití rutinní analýzy obrazu v patologii a hematologii.

Studijní aktivity a metody výuky
Přednášení, Demonstrace, Pracovní činnosti (dílny)
Výstupy z učení
Způsoby pořizování obrazových dat v biologii a využití analýzy obrazu.
Znát a vysvětlit: Způsoby pořizování obrazových dat v biologii a využití analýzy obrazu. Zahrnuje současná dokumentační zařízení, klasické a digitální fotoaparáty, TV a digitální kamery, digitalizace signálu. Makrofotografie a mikrofotografie. Základy počítačové grafiky, software a hardware. Pořizování a archivace obrazových dat, principy manuálního a automatického měření biologických objektů. Předzpracování a zpracování obrazu. Praktická výuka zpracování obrazových dat pomocí Matlabu.
Předpoklady
Seznámit se se způsoby pořizování obrazových dat v biologii a analýzy obrazu.

Hodnoticí metody a kritéria
Rozbor produktů pracovní činnosti studenta (technické práce)

80% účast na seminářích, vykonání písemné zkoušky
Doporučená literatura
  • Georges, G. (2005). Digitální fotografie: 100 praktických návodů a tipů. Computer Press.
  • Harnischmacher, C. (2007). Closeup Shooting: A Guide to Closeup, Tabletop and Macro Photography. Rocky Nook.
  • John C. Russ. The Image Processing Handbook, CRC Press, 2010..
  • Sedlářová a kol. (2013). Mikroskopie a obrazová analýza.
  • Thompson, R. (2006). Naučte se fotografovat dobře makro a detail. Zoner Press.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Experimentální biologie - specializace Experimentální biologie (2021) Kategorie: Biologické obory 2 Doporučený ročník:2, Doporučený semestr: Zimní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biotechnologie a genové inženýrství (2022) Kategorie: Chemické obory 2 Doporučený ročník:2, Doporučený semestr: Zimní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biofyzika (2022) Kategorie: Fyzikální obory 2 Doporučený ročník:2, Doporučený semestr: Zimní