|
Vyučující
|
-
Veselá Denisa, Mgr. Ph.D.
-
Mik Václav, Mgr. Ph.D.
-
Jorda Radek, Mgr. Ph.D.
-
Lenobel René, Mgr. Ph.D.
-
Bělíček Jakub, Mgr.
-
Hájek Libor, Ing.
-
Kryštof Vladimír, prof. RNDr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
Práce s odbornou literaturou. Obecné bibliografické databáze (Pubmed, Web of Science, EBSCO, ProQuest, atd). Plnotextové databáze obecné a vydavatelské. Biotechnologické a medicínské databáze (NCBI, ExPASy, EMBL-EBI, HGNC). Sekvenční a strukturní databáze. Srovnávání sekvencí nukleových kyselin a proteinů. Vyhledávání genů. Funkční genomika. Klasifikace proteinů a proteomika. Posttranslační modifikace proteinů. Fylogenetické studie a srovnávací genomika.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
|
Přednášení, Metody práce s textem (učebnicí, knihou), Demonstrace, Laborování
|
|
Výstupy z učení
|
Naučit se pracovat s odbornou literaturou. Naučit se využívat biologické, chemické a biomedicínské databáze.
Práce s odbornou literaturou. Obecné bibliografické databáze (Pubmed, Web of Science, EBSCO, ProQuest, atd). Plnotextové databáze obecné a vydavatelské. Biotechnologické a medicínské databáze. Sekvenční a strukturní databáze. Srovnávání sekvencí nukleových kyselin a proteinů. Vyhledávání genů. Funkční genomika. Klasifikace proteinů a proteomika. Posttranslační modifikace proteinů. Fylogenetické studie a srovnávací genomika.
|
|
Předpoklady
|
Naučit se pracovat s odbornou literaturou. Naučit se využívat biologické a chemické databáze.
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Písemná zkouška, Seminární práce
100%-ní účast na seminářích, 80% úspěšnost u písemného testu
|
|
Doporučená literatura
|
-
Baxevanis AD, Ouellette BFF. (2004). Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins. WileyBlackwell; 3rd Edition edition.
-
Bishop, M.J. (1999). Genetics Databases. Academic Press.
-
Claverie, J.M. (2006). Bioinformatics for Dummies. John Wiley & Sons; 2nd Edition edition.
-
Sadek, H.A. (2006). Bioinformatics: Principles and Basic Internet Applications. Trafford Publishing.
|