Předmět: Experimentální biologie

« Zpět
Název předmětu Experimentální biologie
Kód předmětu KEB/EXBPR
Organizační forma výuky Přednáška
Úroveň předmětu Bakalářský
Rok studia 3
Semestr Zimní
Počet ECTS kreditů 2
Vyučovací jazyk Čeština
Statut předmětu Povinný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Müller Petr, MUDr. Ph.D.
  • Vojtěšek Bořivoj, RNDr. DrSc.
  • Hrstka Roman, doc. Mgr. Ph.D.
  • Jorda Radek, Mgr. Ph.D.
Obsah předmětu
Biologie nádorové buňky (mechanismy maligní transformace, angiogeneze, tvorba metastáz, protein p53, možnosti predikce, potenciální možnosti využití při terapii, možnosti terapie zaměřené na buněčný cyklus), využití genomických přístupů v experimentální biologii (metody založené na PCR, možnosti čipových analýz genové inženýrství), genová terapie (choroby léčitelné pomocí genové terapie, vektory pro genovou terapii, perspektivy genové terapie), proteinové inženýrství (studium protein-protein interakcí, "phage display" pro hledání protein-protein interakcí, analýza aktivity, "protein engineering"), příprava a purifikace proteinů (využití rozličných expresních systémů pro přípravu proteinů, využití širokého spektra "tag sekvencí" při přípravě proteinů, příprava proteinů pro vývoj monoklonálních protilátek, příprava proteinů pro funkční studie), vývoj, charakterizace a produkce protilátek (teorie přípravy monoklonálních a polyklonálních protilátek, imunizační schémata, používaná zvířata a vhodné antigeny, metody přípravy monoklonálních protilátek, metody přípravy polyklonálních protilátek, metody charakterizace protilátek, produkce, purifikace a značení protilátek), využití protilátek (oblasti aplikace monoklonálích a polyklonálních protilátek, základní a aplikovaný výzkum, humanizace protilátek), modelové systémy v aplikovaném výzkumu (modelové organismy, aplikovaná biologie buňky, modelování biologických systémů), použití lidského biologického materiálu ve výzkumu (lidské tkáně jako zdroj informací a nástroj k validaci experimentálních biologických modelů, možnosti použití a metody zpracování tkáňových vzorků pro účely experimentální biologie), prediktivní a prognostická patologie (odhad biologických vlastností a prognózy zhoubných nádorů, biologické prognostické parametry, biologické prediktory odpovědi na léčbu), vývoj, testování a charakterizace léčiv (účinná látka, farmakodynamika, farmakokinetika, modely používané pro "drug screening", knihovny chemických látek versus přírodní produkty, kvantitativní a strukturní analýza potenciálního léčiva, racionální vývoj léčiv, klinické studie), viry a jejich využiti v experimentální biologii (charakterizace a rozdělení viru, nádory a viry, adenovirové a lentivirové vektory, viry a genová terapie).

Studijní aktivity a metody výuky
Přednášení, Laborování
  • Domácí příprava na výuku - 12 hodin za semestr
  • Příprava na zkoušku - 30 hodin za semestr
Výstupy z učení
Vývoj, charakterizace, testování a metody v experimentální biologii.
Znalosti v oblastech biologie nádorové buňky (mechanismy maligní transformace, angiogeneze, tvorba metastáz, protein p53, možnosti predikce, potenciální možnosti využití při terapii, možnosti terapie zaměřené na buněčný cyklus), využití genomických přístupů v experimentální biologii (metody založené na PCR, možnosti čipových analýz genové inženýrství), genová terapie (choroby léčitelné pomocí genové terapie, vektory pro genovou terapii, perspektivy genové terapie), proteinové inženýrství (studium protein-protein interakcí, "phage display" pro hledání protein-protein interakcí, analýza aktivity, "protein engineering"), příprava a purifikace proteinů (využití rozličných expresních systémů pro přípravu proteinů, využití širokého spektra "tag sekvencí" při přípravě proteinů, příprava proteinů pro vývoj monoklonálních protilátek, příprava proteinů pro funkční studie), vývoj, charakterizace a produkce protilátek (teorie přípravy monoklonálních a polyklonálních protilátek, imunizační schémata, používaná zvířata a vhodné antigeny, metody přípravy monoklonálních protilátek, metody přípravy polyklonálních protilátek, metody charakterizace protilátek, produkce, purifikace a značení protilátek), využití protilátek (oblasti aplikace monoklonálích a polyklonálních protilátek, základní a aplikovaný výzkum, humanizace protilátek), modelové systémy v aplikovaném výzkumu (modelové organismy, aplikovaná biologie buňky, modelování biologických systémů), použití lidského biologického materiálu ve výzkumu (lidské tkáně jako zdroj informací a nástroj k validaci experimentálních biologických modelů, možnosti použití a metody zpracování tkáňových vzorků pro účely experimentální biologie), prediktivní a prognostická patologie (odhad biologických vlastností a prognózy zhoubných nádorů, biologické prognostické parametry, biologické prediktory odpovědi na léčbu), vývoj, testování a charakterizace léčiv (účinná látka, farmakodynamika, farmakokinetika, modely používané pro "drug screening", knihovny chemických látek versus přírodní produkty, kvantitativní a strukturní analýza potenciálního léčiva, racionální vývoj léčiv, klinické studie), viry a jejich využiti v experimentální biologii (charakterizace a rozdělení viru, nádory a viry, adenovirové a lentivirové vektory, viry a genová terapie).
Předpoklady
nespecifikováno

Hodnoticí metody a kritéria
Známkou

80% úspěšnost u písemného testu
Doporučená literatura
  • Alberts, B. a kol. (2002). Molecular Biology of the Cell, 4th ed.. Garland Science, New York.
  • Cassimeris L. et al. (2011). Lewin´s cells.. Sudbury: Jones and Bartlett Publishers.
  • Douglas Hanahan and Robert A. Weinberg. (2011). Hallmarks of Cancer: The Next Generation. Cell 144.
  • Hammers C., M., Stanley J., R.. (2014). Antibody Phage Display: Technique and Applications. Journal of Investigative Dermatology.
  • Harlow, E., Lane, D. (1999). Using antibodies. Cold Spring Harbor, New York.
  • Klinická onkologie 2014 Supplementum. (2014). Postupy a metody v aplikoané molekulární onkologii?.
  • Krejsek, J. a kol. (2004). Klinická imunologie. Nucleus HK.
  • Robert A. (2009). Antibody Phage Display: Methods and Protocols. A product of Humana Press,.
  • Robert A. Weinberg. (2013). The Biology of Cancer. Second Edition,.
  • Slabý, O., et al. (2015). Molekulární medicína. Praha Galén.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Experimentální biologie - specializace Experimentální biologie (2021) Kategorie: Biologické obory 3 Doporučený ročník:3, Doporučený semestr: Zimní