Předmět: Biotechnologické a biochemické informace

« Zpět
Název předmětu Biotechnologické a biochemické informace
Kód předmětu KBI/BTIA
Organizační forma výuky Seminář
Úroveň předmětu Bakalářský
Rok studia nespecifikován
Semestr Letní
Počet ECTS kreditů 2
Vyučovací jazyk Angličtina
Statut předmětu Povinný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Krasylenko Yuliya, Ph.D.
Obsah předmětu
Sylabus: Seminář 1. Vyhledávací nástroje a biologické databáze. Seminář 2. Literatura a citační nástroje. Seminář 3. Vědecké sociální sítě a scientometrie. Seminář 4. Typy a struktura vědeckých článků. Základy akademického psaní. Seminář 5. Úvod do biometrie a biomedicínské statistiky. Seminář 6. Aplikace umělé inteligence (AI) v biologii. Seminář 7. Databáze DNA. Seminář 8. Databáze proteinů. Seminář 9. Predikce struktury proteinů a molekulární dokování. Seminář 10. Databáze biodiverzity a databáze modelových organismů. Seminář 11. Zpracování mikroskopických snímků. Seminář 12. Prezentace mikroskopických snímků. Teoretický úvod vyučujícího na začátku každého semináře, zpracovaný ve formě krátké prezentace. Všech 12 prezentací bude studentům poskytnuto na konci kurzu ve formátu PDF pro jejich pohodlné využití v dalším studiu. Seminar 1. Searching engines and biological databases. NCBI Pubmed: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/ Scopus: https://www.scopus.com/pages/home?display=basic Google Scholar: https://scholar.google.com/ Seminar 2. Literature and citation tools. Mondal, H. (2026). Reference Management in Manuscript Preparation: A Technical Guide for Zotero. Indian Journal of Nuclear Medicine, 40(6), 355-361. How To Use Mendeley - Full Tutorial With Examples: https://www.youtube.com/watch?v=PJXnfBSq4Lg Seminar 3. Science social networking and scientometrics. ResearhGate: https://www.researchgate.net/ Marginson, S. (2022). Global science and national comparisons: beyond bibliometrics and scientometrics. Comparative Education, 58(2), 12 Seminar 4. Types and structure of research papers. Basics of academic writing. Chauhan, P. (2022). Fundamentals of academic writing: A literature review. Journal of NELTA, 27(1-2), 161-180. Bailey, S. (2024). The essentials of academic writing for international students. Routledge. Yucuis, N. (2016). Basics of Academic Writing. Seminar 5. Intro to biometry and biomedical statistics. Hoffman, J. I. (2019). Biostatistics for medical and biomedical practitioners. Academic Press. Hawkins, D. (2019). Biomeasurement: a student's guide to biological statistics. Oxford University Press. Mead, R. (2017). Statistical methods in agriculture and experimental biology. Chapman and Hall/CRC. Seminar 6. Artificial intelligence (AI) applications in biology. Hassoun, S., Jefferson, F., Shi, X., Stucky, B., Wang, J., & Rosa Jr, E. (2021). Artificial intelligence for biology. Integrative and Comparative Biology, 61(6), 2267-2275. Aceves-Fernandez, M. A. (2019). Artificial intelligence: applications in medicine and biology. BoD-Books on Demand. Dogan, G., Vaidya, D., Bromhal, M., & Banday, N. (2024). Artificial intelligence in marine biology. In A Biologist s Guide to Artificial Intelligence (pp. 241-254). Academic Press. Sun, N. (2026). Challenges and potential applications of AI in systems biology. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 27(2), 89-90. Seminar 6. Artificial intelligence (AI) applications in biology. Hassoun, S., Jefferson, F., Shi, X., Stucky, B., Wang, J., & Rosa Jr, E. (2021). Artificial intelligence for biology. Integrative and Comparative Biology, 61(6), 2267-2275. Aceves-Fernandez, M. A. (2019). Artificial intelligence: applications in medicine and biology. BoD-Books on Demand. Dogan, G., Vaidya, D., Bromhal, M., & Banday, N. (2024). Artificial intelligence in marine biology. In A Biologist s Guide to Artificial Intelligence (pp. 241-254). Academic Press. Sun, N. (2026). Challenges and potential applications of AI in systems biology. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 27(2), 89-90.

Studijní aktivity a metody výuky
Přednášení, Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming)
Výstupy z učení
Seznámení se s různými aspekty využívání informací pro studium a vědeckou práci v oblasti biotechnologií se zaměřením na on-line informační zdroje.
Po absolvování seminářů budou studenti schopni pracovat s vybranými multioborovými i specializovanými databázemi, sestavit rešeršní dotaz, pracovat s výsledky vyhledávání, získat plné texty primárních dokumentů a použít je při přípravě vědecké publikace. Budou také schopni získávat a interpretovat základní informace z různých biologických databází.
Předpoklady
Studenti se očekává, že v průběhu kurzu přednesou dvě nebo tři prezentace na vybraná témata v anglickém jazyce, v závislosti na počtu zapsaných studentů.

Hodnoticí metody a kritéria
Seminární práce

Pravidelná účast na seminářích, vypracování zadaných individuálních úkolů.
Doporučená literatura
  • selected by supervisor.
  • 1. On-line elektronické informační zdroje.
  • Hassoun, S., Jefferson, F., Shi, X., Stucky, B., Wang, J., & Rosa Jr, E. Artificial intelligence for biology. 2021.
  • Chauhan, P. Fundamentals of academic writing: A literature review. 2022.
  • Mondal, H. Reference Management in Manuscript Preparation: A Technical Guide for Zotero. 2026.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biotechnologie a genové inženýrství (2026) Kategorie: Chemické obory 2 Doporučený ročník:2, Doporučený semestr: Letní