|
Vyučující
|
-
Kouřil Roman, RNDr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
Typy formátů mikroskopických snímků z elektronového mikroskopu. Metody 2D a 3D jedno-částicové analýzy projekcí proteinových komplexů. Analýza tomografických snímků z elektronového mikroskopu a rekonstrukce tomogramu. Fitování výsledných projekcí strukturním modelem z PDB databáze a příprava obrázků pro publikaci. Základy práce s programy pro vizualizaci strukturních modelů (např. Pymol, Chimera, Swiss PDB Viewer, příp. jiné).
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
|
Přednášení, Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Laborování
|
|
Výstupy z učení
|
|
|
|
Předpoklady
|
nespecifikováno
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
nespecifikováno
Úspěšné absolvování semináře. Kolokvium, diskuse na dané téma.
|
|
Doporučená literatura
|
-
Online dokumentace k aktualizovaným verzím softwaru využívaného pro obrazovou analýzu projekcí z elektronového mikroskopu a strukturních modelů.
-
Williams, D. B., Carter, C. B. (2009). Transmission electron microscopy: A textbook for materials science (4vol set).
|