|
Vyučující
|
-
Opatíková Monika, Mgr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
Přednášky budou zaměřené na téma zásad práce s biologickým materiálem a jeho následnou analýzu. Cvičení je zaměřeno především na metody související se zpracováním a přípravou vzorků na strukturní analýzu. Popři osvojení si základů práce v chemické laboratoři (pipetování, práce ve flow boxe a digestoři, pěstování rostlin za kontrolovaných podmínek) si student prakticky vyzkouší izolaci tylakoidních membrán z rostlin, přípravu takto vyizolovaných membrán na jejich následnou elektroforetickou separaci v nativním stavě, přípravu sacharózových gradientů a ultracentrifugacii jako i přípravu denaturačních gelů, western blot a vizualizace separovaných proteinů přenesených na membránu pomoci protilátek, elektroforetickou separaci v druhém rozměru a barvení gelů i re-inokulace řas v sterilních podmínkách.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
|
Přednášení, Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Laborování
|
|
Výstupy z učení
|
Absolvováním předmětu získá student teoretické znalosti o metodách centrifugace, dialýzy, chromatografie a jejích různých typech (adsorpční, iontovo-výměnná, gelová, afinitní, HPLC,?), elektromigračních metodách (nativní, denaturační, ?) spojených s následnou vizualizaci separovaných proteinů. Dále student získá přehled o způsobech přenosu proteinů z gelů na membránu, imunochemických metodách, hmotnostní spektrometrii proteinů, průtokové cytometrii a dalších metodách, které buď přímo souvisejí s přípravou vzorků nebo představují doplňující metodiku pro strukturní analýzu proteinů.
|
|
Předpoklady
|
nespecifikováno
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
nespecifikováno
Ústní zkouška, diskuse na dané téma.
|
|
Doporučená literatura
|
-
Alberts, B., Johnson, A., Lewis, J., Morgan, D., Raff, M., Roberts, K., Walter, P. (2022). Molecular Biology of the Cell. 7th edition. W. W. Norton & Company.
-
Kodíček, M., Valentová, O., Hynek, R. (2022). Biochemie: chemický pohled na biologický svět. Praha.
-
McKee.T, McKee, J. R. (2020). Biochemistry: The Molecular Basis of Life.
-
Pingoud, A., Urbanke, C., Hoggett J., Jeltsch, A. (2002). Biochemical Methods, A Concise Guide for Students and Researchers. Wiley-VCH.
|