Předmět: Konfokální mikroskopie a analýza obrazu

« Zpět
Název předmětu Konfokální mikroskopie a analýza obrazu
Kód předmětu KBF/MIK
Organizační forma výuky Přednáška + Seminář
Úroveň předmětu Magisterský
Rok studia 2
Semestr Zimní
Počet ECTS kreditů 2
Vyučovací jazyk Čeština
Statut předmětu Povinný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Rác Marek, Mgr. Ph.D.
Obsah předmětu
Historie mikroskopie, základy optiky, optická soustava, typy mikroskopů, stavba mikroskopu, typy objektivů kontrastní techniky: temné pole, fázový kontrast, Nomarski kontrast, Hoffmanův kontrast Fluorescenční mikroskopie: princip, přehled fluoroforů, typy fluorescenčních mikroskopů, využití Pokročilé metody fluorescenční mikroskopie: FRAP, FRET, FILM, FCS Konfokální mikroskopie: princip, typy konfokálních mikroskopů včetně multi-beam, multifotonové, TIRF, HILO a light-sheet fluorescenční mikroskopie Superrezoluční techniky: 4PI, STED, GSDIM, SIM, FPALM, PALM, STORM, SLIM, NSOM Způsob detekce světelného signálu: CCD, CMOS, EM-CCD, fotonásobiče Analýza digitálního obrazu: snímaní a digitalizace obrazu, bitmapy, velikost, rozlišení, komprese, barva obrazu, analýza obrazu v programu Imaris, analýza obrazu v programu ImageJ

Studijní aktivity a metody výuky
Přednášení, Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Laborování
Výstupy z učení
Cílem je seznámení s pokročilými mikroskopickými metodami a se způsoby analýzy digitálního obrazu.

Předpoklady
nespecifikováno

Hodnoticí metody a kritéria
nespecifikováno
Úspěšné absolvování semináře. Kolokvium, diskuse na dané téma.
Doporučená literatura
  • (2011). Basic confocal microscopy. New York.
  • (2006). Handbook of biological confocal microscopy. New York.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Strukturní biologie (2026) Kategorie: Biologické obory 2 Doporučený ročník:2, Doporučený semestr: Zimní