Předmět: Diagnostické metody v rostlinolékařství

« Zpět
Název předmětu Diagnostické metody v rostlinolékařství
Kód předmětu KBC/DMR
Organizační forma výuky Přednáška
Úroveň předmětu Magisterský
Rok studia 1
Semestr Letní
Počet ECTS kreditů 2
Vyučovací jazyk Čeština
Statut předmětu Povinně-volitelný, Volitelný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Tománková Kateřina, RNDr. Ph.D.
Obsah předmětu
1. Odbor diagnostiky škodlivých organismů rostlin - představení činností laboratoří. Akreditace laboratoří dle ČSN EN ISO/IEC 17025:2018. Prohlídka laboratoří. 2. Diagnostické metody využívané v Laboratoři bakteriologie ÚKZÚZ: izolace bakterií z rostlinného materiálu, kultivace, mikroskopie, plynová chromatografie (GC), hmotnostní spektrometrie (MALDI-TOF MS), identifikační systém Biolog, metody molekulárně-biologické. Biologické testy pro potvrzení fytopatogenity bakterií. 3. Diagnostické metody využívané v Laboratoři virologie ÚKZÚZ: ELISA, biologické testy, udržování kolekce referenčního materiálu. 4. Diagnostické metody využívané v Laboratoři molekulární biologie ÚKZÚZ: polymerasová řetězová reakce (PCR, qPCR, mPCR, nPCR, RT-PCR, PCR-RFLP), sekvenace nukleových kyselin (DNA barcoding, NGS). 5. Zavádění nových diagnostických testů v laboratořích ÚKZÚZ. Zdroje a EPPO standardy. Validace a verifikace testů - obecná kritéria a pravidla pro jednotlivé skupiny organismů, výkonnostní parametry, praktické ukázky validací molekulárních metod - faktory ovlivňující jednotlivé výkonnostní parametry. Příklady validací metod ve virologii, bakteriologii, mykologii. 6. Mezinárodní projekty a spolupráce. Evropské referenční laboratoře a národní referenční laboratoře. Testování kvality - Zkoušení způsobilosti laboratoří (Proficiency tests)

Studijní aktivity a metody výuky
nespecifikováno
Výstupy z učení
Předpoklady
nespecifikováno

Hodnoticí metody a kritéria
nespecifikováno
Doporučená literatura
  • Norma ČSN EN ISO/IEC 17025, Posuzování shody -- Všeobecné požadavky na způsobilosti zkušebních a kalibračních laboratoří..
  • Alberts, B. a kol. (1998). Základy buněčné biologie. Espero Publishing, Ústí nad Labem.
  • Alberts, B., Heald, R., Johnson A., Morgan, D., Roberts, K., Walter, P., Wilson, J., Hunt, T. (2022). Molecular biology of the cell (7. vydání).
  • Bartlett, J.M.S, Stirling, D. (2003). PCR Protocols (second edition).
  • Bustin, S. A. (2004). A-Z of Quantitative PCR.
  • Filion, M. (2012). Quantitative Real-Time PCR in Applied Microbiology.
  • Kůdela V., Novacky A., Fucikovsky L. (2002). Rostlinolékařská bakteriologie. Academia.
  • Rosypal, S. (1996). Úvod do molekulární biologie. Brno.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biochemie (2022) Kategorie: Chemické obory - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Analytický biochemik (2024) Kategorie: Chemické obory 1 Doporučený ročník:1, Doporučený semestr: Letní