Předmět: Information in Biochemistry

« Zpět
Název předmětu Information in Biochemistry
Kód předmětu KBC/BCHIE
Organizační forma výuky Seminář
Úroveň předmětu Bakalářský
Rok studia nespecifikován
Semestr Letní
Počet ECTS kreditů 2
Vyučovací jazyk Angličtina
Statut předmětu Povinně-volitelný, Volitelný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Petřivalský Marek, prof. Mgr. Dr.
  • Jemelková Jana, Mgr. Ph.D.
Obsah předmětu
1. Úvod do informací ve vědě - ukládání, vyhledávání a výměna informací v historii a současnosti lidstva a vědy. 2. Primární informační zdroje - vědecké články (původní a přehledové články, struktura a obsah článků - úvod, metody, výsledky, diskuse, citovaná literatura, autoři a afiliace, podání, DOI článku. Recenzní a redakční procesy. 3. Vědecké časopisy - relevantní časopisy z oblasti přírodních věd a biochemie. Obsah časopisů, formátování, on-line dostupnost - abstrakty a plné texty. Vydavatelé časopisů a webové portály, služba CrossRef. 4. Informační databáze - plné texty a citační databáze. Vyhledávání pomocí klíčových slov, jména autora, vyhledávání struktur. Chemické databáze - Beilstein Abstracts. Web of Science, SCOPUS, PubMed. Portál NCBI, BRENDA, EXPASY. Služba Google Scholar. On-line zdroje a elektronická knihovna Univerzity Palackého. 5. Ostatní informační zdroje - editované knihy a monografie, knižní řady. Patentové databáze. Informace o výrobcích od firem - "bílé knihy", bezpečnostní listy. 6. Vědecká setkání - ústní a posterové prezentace, plenární přednášky a konferenční sekce, sborníky abstraktů, satelitní sympozia. 7. Sociální média a sítě - specifické využití při výměně vědeckých informací. Vědecké sítě - LinkedIn, ResearchGate, Academia. Služby pro sdílení dokumentů. 8. Přístup k informacím a náklady - systém placeného předplatného a otevřeného přístupu, náklady na publikace a financování, preprintové servery, predátorské časopisy a konference. 9. Základy scientometrie a bibliometrie - indexace časopisů, impakt článků, časopis a instituce, citační analýza, h-index, identifikátor ORCID. 10. Osobní úložiště informací a citování - lokální a cloudová úložiště, bibliografický software (EndNote a EndNote Web, OBD Pro), citační nástroje při zpracování textu.

Studijní aktivity a metody výuky
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Metody práce s textem (učebnicí, knihou), Projekce (statická, dynamická)
  • Účast na výuce - 26 hodin za semestr
  • Příprava na zápočet - 20 hodin za semestr
  • Domácí příprava na výuku - 10 hodin za semestr
Výstupy z učení
Poskytnout studentům praktické dovednosti, nezbytné pro jejich další studium, týkající se vyhledávání chemické a biochemické literatury a databází, vyhledávání, ukládání a využívání dat v jejich kvalifikačních pracích.
Získat přehled o dostupných informačních zdrojích využitelných pro další studium a přípravu kvalifikační prácí, získat základní dovednosti pro využití informačních zdrojů, navrhovat řešení modelových problémů při zpracování literárních řešení.
Předpoklady
Study of bachelors program of Biochemistry.

Hodnoticí metody a kritéria
Analýza výkonů studenta, Systematické pozorování studenta, Písemný test

100% účast na výuce Úspěšné dokončení tří domácích úkolů Úspěšné absolvování závěrečného písemného testu ziskem nejméně 50% maximálního počtu bodů a navazujícího ústního kolokvia.
Doporučená literatura
  • Bawden, D., Robinson, L. (2012). Introduction to Information Science. Neal-Schuman Publishers, 1st edition.
  • Vymětal, J. (2010). Informační zdroje v odborné literatuře. Praha, Wolters Kluwer ČR (Aspi).


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Bioinformatika (2021) Kategorie: Informatické obory 1 Doporučený ročník:1, Doporučený semestr: Letní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biochemie (2022) Kategorie: Chemické obory - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní