Předmět: Současná mikroskopie a analýza obrazu

« Zpět
Název předmětu Současná mikroskopie a analýza obrazu
Kód předmětu BOT/SMAO
Organizační forma výuky Přednáška + Cvičení
Úroveň předmětu Magisterský
Rok studia nespecifikován
Semestr Letní
Počet ECTS kreditů 4
Vyučovací jazyk Čeština
Statut předmětu nespecifikováno
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Sedlářová Michaela, doc. RNDr. Ph.D.
  • Ondřej Vladan, doc. RNDr. Ph.D.
Obsah předmětu
Principy světelné mikroskopie, fázový kontrast, Nomarského diferenciální kontrast. Fluorescenční mikroskopie, konfokální laserová rastrovací mikroskopie, techniky s interakcemi fluorescenčních signálů (FRAP, FRET, FLIM), korelativní mikroskopie. Metody fluorescenčního značení vzorků (imunohistochemické barvení, fluorochromy pro in vivo mikroskopii, fluorescenční proteiny). Analýza obrazu - kolokalizace signálů, měření intenzity, rozměrů, počítání objektů. Softwary.

Studijní aktivity a metody výuky
Demonstrace, Projekce (statická, dynamická)
Výstupy z učení
Studenti budou seznámeni s novými trendy v oblasti světelné mikroskopie, která je nedílnou součástí většiny odvětví biologie. Softwarové zpracování získaných obrazových dat doplní mikroskopickou část.
Po absolvování předmětu by měl student: - ovládat techniky světelné mikroskopie - fluorescenčně značit vzorky podle standardních protokolů - získat a zpracovat obrazová data
Předpoklady
-

Hodnoticí metody a kritéria
Ústní zkouška, Písemná zkouška, Analýza výkonů studenta

účast + praktické zpracování preparátů a obrazových dat
Doporučená literatura
  • Abelson J.N., Simon M.I., Conn P.M. (1999). Microscopy. Methods in Enzymology, Volume 307. Academic Press.
  • Claxton N.S., Fellers TJ., Davidson M.W. (2004). Laser Scanning Confocal Microscopy. Hibbs A.R. (2004) Confocal Microscopy for Biologists. BIOCON Melbourne.
  • Pawley J.B. (2005). Handbook of Biological Confocal Microscopy, 3rd Edition. New York.
  • Price R., Jerome J. (2010). Basic Confocal Microscopy.
  • Skalický J., Bělohlavý K., Večeřa J. (2010). http://www.ceskatelevize.cz/porady/10209988352-zaslapane-projekty/%20409235100061018-mikroskop-ktery-predbehl-dbu/?backaddr=search&obdobif=archiv&broad=409+235+10006%2F1017.
  • Svítil P., Kuchař J. (2009). Konfokální mikroskopie. na http://fyzika.fce.vutbr.cz/studium-studijni-materialy-konfokal-mikroskopie.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr