|
Vyučující
|
-
Kitner Miloslav, RNDr. Ph.D.
-
Majeský Luboš, RNDr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
Kurz je zaměřen na praktické zvládnutí základních molekuárně-genetických technik používaných v biosystematice rostlin. Student by po absolvování tohoto kurzu měl být schopen samostatně vykonávat izolaci DNA, ověřit její kvalitu a kvantitu, provádět PCR reakce a být schopen zpracovat výsledky Sangerova sekvenování. - Metody molekulárních markerů využívaných pro studium biosystematiky rostlin. Jejich přehled, využití, výhody a nevýhody. - Zpracování a práce se sekvenačními daty, práce s databázemi, práce s běžným statistickým SW a aplikacemi.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
|
Přednášení, Pracovní činnosti (dílny)
|
|
Výstupy z učení
|
Kurz je zaměřen na praktické zvládnutí základních technik molekulární biologie, které jsou v současnosti používány v populačně genetických a fylogenetických studiích rostlin: zvládnutí izolace DNA, PCR technik, separace a detekce PCR fragmentů, příprava vzorků pro sekvenační laboratoř, vyhodnocení elektroforetogramů, práce s databázemi a statistickými programy.
Po absolvování kurzu by student měl být schopen: - provést izolaci DNA z rostlinného materiálu - rutinně provádět PCR reakce - optimalizovat podmínky PCR reakce - provést editaci sekvenačních dat, exportovat výsledná data a provést konstrukci fylogenetického stromu
|
|
Předpoklady
|
nespecifikováno
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Ústní zkouška
kolokvium: 3 otázky - dle sylabu v rozsahu přednášek a doporučené literatury a) Základní vědomosti o stavbě DNA a její biologické funkci, princip PCR reakce b) Pochopení principů technik molekulárních markerů c) Přehled o využití molekulárních markerů v biosystemetice rostlin
|
|
Doporučená literatura
|
-
Chaloupek O. 2000. Genetická diverzita, šlechtění a semenářství. Academia, Praha, 311 pp..
-
Mazura I., Michalová K., Brdička R., Mácha J. 2001. Speciální metody molekulární biologie. Univerzita Karlova v Praze, Karolinum, 101pp..
-
Vaculná L., Majeský Ľ., Kobrlová L., Kitner M. Záchrana zelených pokladů: využití metod populační genomiky v ochraně kriticky ohrožených druhů rostlin. Praha. 2024.
-
Weising K., Nybom H., Wolff K., Kahl G. 2005. DNA fingerprinting in plants. Principles, methods and applications (2nd ed). CRC Press, Boca Raton, FL, USA, 444pp..
|