|
Vyučující
|
-
Matušinský Pavel, Mgr. Ph.D.
-
Sedlářová Michaela, doc. RNDr. Ph.D.
-
Kitner Miloslav, RNDr. Ph.D.
-
Mieslerová Barbora, doc. RNDr. Ph.D.
-
Navrátil Milan, prof. RNDr. CSc.
-
Šafářová Dana, Mgr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
1,2 - Úvod do problematiky diagnostiky fytopatogenů. Mikroskopické metody určování jednotlivých skupin fytopatogenů (světelná, fluorescenční a elektronová mikroskopie). Kultivační testy (mikromycety, bakterie). Diagnostika fytopatogenních mikroorganismů podle symptomů u hostitelských rostlin: hodnocení fenotypu a stupně napadení hostitelských rostlin. Neinvazivní metody hodnocení poškození porostů (spektrální metody, velkoplošná fenotypizace, dálkový průzkum Země). 3 - Laboratorní metody pro typizaci patogenů - ELISA testy, izolace nukleových kyselin, PCR reakce, molekulární markery (RFLP, ISSR, SSR, AFLP, sekvenování, NGS, q-PCR) 4,5 - Diagnostika fytopatogenních hub. Sběr, transport a zpracování vzorků rostlin se symptomy chorob. Metody izolace, kultivace a uchovávání. Příklady. 6,7 - Diagnostika fytopatogenních bakterií. Sběr, transport a zpracování vzorků rostlin se symptomy chorob. Metody izolace, kultivace a uchovávání. Příklady. 8,9 - Diagnostika fytopatogenních virů. Sběr, transport a zpracování vzorků rostlin se symptomy chorob. Metody izolace, kultivace a uchovávání. Příklady.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
|
Demonstrace, Projekce (statická, dynamická), Laborování
|
|
Výstupy z učení
|
Cílem kurzu je představit studentům přehled základních postupů detekce rostlinných patogenů (metody makro- a mikroskopie, kultivace, serologická a molekulární detekce patogenů). Získání praktické dovednosti při aplikaci těchto metod.
Student získá přehled o diagnostických metodách ve fytopatologii
|
|
Předpoklady
|
nespecifikováno
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Písemná zkouška, Analýza výkonů studenta
|
|
Doporučená literatura
|
-
Agrios, G.N. (2005). Plant Pathology. 5th Edition.. Elsevier AP, Oxford.
-
Bursová, Š. (´201). Mikrobiologické laboratorní metody. Veterinární a farmaceutická univerzita Brno.
-
Narayanasamy, P. (ed.). (2011). Microbial Plant Pathogens-Detection and Disease Diagnosis: Bacterial and Phytoplasmal Pathogens, Vol. 2.. Springer.
-
Narayanasamy, P. (ed.). (2011). Microbial Plant Pathogens-Detection and Disease Diagnosis: Fungal Pathogens, Vol. 1.. Springer.
-
Narayanasamy, P. (ed.). (2011). Microbial Plant Pathogens-Detection and Disease Diagnosis: Viral and Viroid Pathogens, Vol. 3. Springer.
|