|
Vyučující
|
-
Havlíček Vladimír, prof. Ing. Dr.
|
|
Obsah předmětu
|
1. Úvod - možnosti hmotnostní spektrometrie v analýze organických molekul 2. Desorpční techniky pro ionizaci malých polárních analytů a velkých biomolekul 3. Nové moderní vysoce rozlišující analyzátory: orbitrap a cyklotron 4. Desorpční elektrosprej (DESI) a mikrochirurgické nástroje (JeDi): techniky zjednodušující přípravu vzorku, techniky pro analýzu tkání a celé krve 5. Hledání biomarkerů: analýza na čipech (SELDI) 6. Metabolomika 7. Rezonance plazmonů na rozhraní kov-dielektrium (Surface Plasmon Resonance): studium interakcí 8. Hmotnostní mikroskopie v histologii a jinde: přímý přístup k biomarkerům 9. Diagnostika vybraných typů onemocnění
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Přednášení, Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming)
- Účast na výuce
- 20 hodin za semestr
- Příprava na zkoušku
- 80 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
1. Úvod - možnosti hmotnostní spektrometrie v analýze organických molekul 2. Desorpční techniky pro ionizaci malých polárních analytů a velkých biomolekul 3. Nové moderní vysoce rozlišující analyzátory: orbitrap a cyklotron 4. Desorpční elektrosprej (DESI) a mikrochirurgické nástroje (JeDi): techniky zjednodušující přípravu vzorku, techniky pro analýzu tkání a celé krve 5. Hledání biomarkerů: analýza na čipech (SELDI) 6. Metabolomika 7. Rezonance plazmonů na rozhraní kov-dielektrium (Surface Plasmon Resonance): studium interakcí 8. Hmotnostní mikroskopie v histologii a jinde: přímý přístup k biomarkerům 9. Diagnostika vybraných typů onemocnění
Porovnat výhody a nevýhody jednotlivých metod analýzy biomarkerů pomocí MS, vybrat pro daný účel vhodnou metodu, interpretovat výsledky
|
|
Předpoklady
|
Úspěšné absolvování magisterského oboru analytická chemie.
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Ústní zkouška, Písemná zkouška
Seznámit se s problematikou podle doporučení garanta nebo učitele a prokázat schopnost téma vysvětlit a diskutovat o něm.
|
|
Doporučená literatura
|
-
(2007). International Journal of Mass Spectrometry, Special Issue on Imaging Mass Spectrometry, Vol. 260.
-
Holčapek, M. (editor). (2001). Spojení vysokoúčinné kapalinové chromatografie a hmotnostní spektrometrie. Spektroskopická společnost Jana Marca Marci a Univerzita Pardubice, Pardubice.
-
Jegorov, A., Hajduch, M., Sulc, M., Havlicek, V. (2006). Nonribosomal cyclic peptides: specific markers of fungal infections. J. Mass Spectrom., 41: 563.
-
Kinter, M.,Sherman N. E. (2000). Protein Sequencing and identification using tandem mass spectrometry. John Wiley and sons, New York.
-
Skládal, P., Macholán, L. (1997). Biosensory - Současný stav a perspektivy. Chem. Listy 91; 105-113.
-
Snyder, A. P. (2000). Interpreting protein mass spectra. American Chemical Society and Oxford University Press, Washington D.C.
|