|
Vyučující
|
-
Veselý Milan, doc. RNDr. Ph.D.
-
Trávníček Bohumil, doc. RNDr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
Taxonomie jako věda. Význam taxonomie pro ostatní biologické discipliny. Významné osobnosti v dějinách taxonomie. Mikrotaxonomie: Fenon, taxon, kategorie. Kategorie druhu. Koncepce druhu - typologická, nominalistická a biologická. Definice. Taxon druh. Problematika taxonomické klasifikace polyploidních, apomiktických a autogamických rostlin. Hybridní a hybridogenní taxony u rostlin. Polytypické druhy. Význam a rozšíření polytypických druhů. Vnitrodruhové (infraspecifické) kategorie a termíny. Problém poddruhu. Makrotaxonomie: Teorie biologické klasifikace. Hlavní kroky v taxonomické proceduře. Vyšší kategorie a vyšší taxony. Principy hierarchické klasifikace. Taxonomické znaky: morfologické a molekulární markery. Kladistika. Kladistická analýza, homologie a homoplasie. Znaky plesiomorfní a apomorfní. Polarizace znaků. Kladistická klasifikace, Pojetí monofylie (holofylie), rozdíly mezi kladistikou a evoluční systematikou. Metody rekonstrukce fylogeneze: distanční metody, parsimonie, maximum likelihood, bayesiánské inference, metody datování fylogenetických událostí, bayesiánská rekonstrukce ancestrálních znaků. Molekulární fylogenetika: molekulární datové soubory, zpracování chromatogramů, formáty znakových souborů, GEnBANK jako zdroj dat, používaný software pro molekulárně fylogenetické analýzy, multimarkerové soubory, parciální a total evidence analýza, nextgen data ve fylogenetice, studium evoluce znaků, podpora větví. Algoritmické metody delimitace druhů, barcoding, GMYC, PTP model, molekulární znaky pro definici druhů, hodnocení genetické diversity v geografickém prostoru. Mezinárodní pravidla botanické a zoologické nomenklatury (výběr nejdůležitějších pravidel, seznámení s anglicou terminologií, Code v originální anglické verzi).
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
|
Přednášení
|
|
Výstupy z učení
|
Taxonomie jako věda. Význam taxonomie pro ostatní biologické discipliny. Metody taxonomické práce
Po absolvování kurzu by student měl být schopen: - Vysvětlit základní pojmy taxonomie. - Definovat taxon a druh. - Vysvětlit teorii biologické klasifikace. - Porovnat kladistikou a evoluční systematiku. - vysvětlit postupy používané ve fylogenetice - Vyjmenovat hlavní pravidla Mezinárodních pravidel botanické a zoologické nomenklatury.
|
|
Předpoklady
|
Bez předběžných požadavků, základní kurz
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Ústní zkouška
ústní zkouška - 3 otázky: 1. botanická část, 2. zoologická část, 3. nomenklatura (podle specializace botanika/zoologie)
|
|
Doporučená literatura
|
-
Briggs D., Walters S.M. (1997). Plant Variation and Evolution. Cambridge University Press.
-
Felsenstein, J. Inferring Phylogenies..
-
Greuter, W. et al. (2000). Medzinárodný kód botanickej nomenklatúry (Saint Louis Code). Zpr. Čes. Bot. Společ., Praha, Příloha 2000/1: 1-121.
-
Hall B. G. Trees Made Easy: A How - To Manual..
-
Houša V. a Štys P. (1988). Mezinárodní pravidla zoologické nomenklatury, 3. vydání. Academia, Praha.
-
Houša, V. (1980). Základy taxonomie pro zoopaleontology. Skripta PřF UK. Státní pedagogické nakladatelství, Praha.
-
International Comission on Zoological Nomenclature. (1999). International Code of Zoological Nomenclature, Fourth Edition. London.
-
International Comission on Zoological Nomenclature. (1985). International Code of Zoological Nomenclature, Third Edition. London.
-
Mayr, E. & Ashlock, P. D. (1991). Principles of systematic zoology. 2nd edition. McGraw- Hill, Inc., New York etc.
-
Mayr, E. (1969). Principles of systematic zoology. McGraw-Hill Book Company, New York.
-
McNeill J. (ed.). International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants (Melbourne Code), 2011. Koeltz Scientific Books.
-
Page, R. D. M. and Holmes, E. C. Molecular Evolution: A phylogenetic approach..
-
Stace, C. A. (1980). Plant Taxonomy and Biosystematics. London.
-
Stuessy, T. F. (1990). Plant Taxonomy. New York.
|