Zkouška bude vyžadovat především znalosti získané v předmětu Bioorganická chemie a Cvičení z bioorganické chemie. Jednotlivé okruhy pro tento předmět: 1. Základní kritéria bioorganické chemie ? orientace a proximita molekul, molekulární adaptace, molekulární asymetrie a molekulární rozpoznávání. Důležité funkční skupiny v biomolekulách. 2. Biosyntetické reakce. Typy reakcí v živých organizmech a porovnání s přístupy v organické chemii ? katalytické reakce, fosfáty v biosyntéze, hydridový transfer, oxidace, eliminace, acylace, alkylace, redukce, kondensace. Analogie mezi organickými reakcemi a biochemickými transformacemi, porovnání s přístupy v organické chemii. Ukázka na glykolýze, beta oxidaci a Calvinově cyklu. 3. Bioorganická chemie aminokyselin. Aminokyseliny, nestandardní aminokyseliny, syntéza a asymetrická syntéza. 4. Bioorganická chemie peptidů. Chemická syntéza peptidů - princip syntézy na pevné fázi. Chránění funkčních skupin při chemické syntéze peptidů. Nativní chemická ligace. Rekombinantní proteiny. Peptidomimetika. Aktivní látky na bázi peptidomimetik, cyklických peptidů a nepřírodních aminokyselin. 5. Enzymy, inhibice enzymů a drug design. Význam enzymů v medicíně. Organické kofaktory. Vybrané proteiny (proteinkinasy a proteasy). 6. Bioorganická chemie nukleových kyselin 1. Syntéza složek nukleových kyselin. Oligonukleotidová syntéza. PNA, LNA. Antisense terapie. Antigenová terapie. 7. Bioorganická chemie nukleových kyselin 2. Ribozymy. Riboswitches a aptamery. Katalytické RNA. RNA interference, siRNA, miRNA. 8. Bioorganická chemie sacharidů 1. 10 základních stavebních kamenů v glykanech, nomenklatura, relativní stabilita alfa a beta anomeru. Glykosidická vazba, chemická a enzymatická hydrolýza glykosidické vazby (glykosylhydroláza ? virus chřipky). Glykosyltransferasy. Chemická syntéza oligosacharidů. 9. Bioorganická chemie sacharidů 2. Polysacharidy ? celulóza, cyklodextriny, chitin, hyaluronan, polysialové kyselliny (meningokok). Glykoproteiny ? glykosylace lidských proteinů, syntéza glykoproteinů, proteoglykany. 10. Bioorganická chemie sacharidů 3. Glykolipidy ? glykosfingolipidy. Glykosylace v cytosolu. Sacharidový kód, lektiny. Syntetické vakcíny. Glukosa a diabetes. 11. Bioorganická chemie lipidů. Polyketidy a terpeny. Liposomy a imunoliposomy ? molekulární stavba, principy fungování v oblasti experimentální medicíny. 12. Receptory a chemická kontrola signální transdukce 1. Přenos signálu, základní signální dráhy v lidských buňkách. Buněčné receptory. Receptory na buněčném povrchu, které přímo interagují s transkripčními faktory. 13. Receptory a chemická kontrola signální transdukce 2. Tyrosinkinázový receptor. Receptory spřažené s G proteiny. Ionotropní receptory. Receptory smrti. Dráhy kontrolované malými plyny.
|