| Název předmětu | Chemie nukleových kyselin |
|---|---|
| Kód předmětu | OCH/CNK |
| Organizační forma výuky | Přednáška |
| Úroveň předmětu | Magisterský |
| Rok studia | nespecifikován |
| Semestr | Zimní |
| Počet ECTS kreditů | 3 |
| Vyučovací jazyk | Čeština |
| Statut předmětu | Povinně-volitelný |
| Způsob výuky | Kontaktní |
| Studijní praxe | Nejedná se o pracovní stáž |
| Doporučené volitelné součásti programu | Není |
| Vyučující |
|---|
|
| Obsah předmětu |
|
1. Úvod a seznámení se s problematikou a historický přehled objevů v oblasti nukleových kyselin, přirozené nukleosidy a nukleotidy, báze, jejich interakce, Watson - Crickovy vodíkové vazby, alternativní vodíkové vazby, další typy interakcí, chemické a fyzikální vlastnosti, katalytické vlastnosti RNA. 2. Metodika syntéz umělých analogů nukleosidů, C-nukleosidy a jejich příprava a vlastnosti, modifikace bazí. Příklady běžně užívaných reakčních schémat. Syntéza DNA a RNA na pevné fázi, fosforamiditový a H-fosfonátový přístup, chránící skupiny, automatická syntéza, výtěžky, odchránění, úskalí těchto syntéz. Metody purifikace oligonukleotidů. Oligonukleotidy s modifikovanými fosfáty, jejich využití. Metabolizmus složek nukleových kyselin (biosyntéza a degradace). 3. Replikace, transkripce, translace; centrální dogma a výjimky z něj, současné teorie o evoluci nukleových kyselin a proteinů. 4. Regulace v rámci centrálního dogmatu, regulace transkripce, postranskripční a posttranslační regulace. Epigenetika. Úpravy primárního transkriptu - capping, polyadenylace, alternativní sestřih, 5. Telomery, telomerasa, senescence. Poškození a mutace DNA, opravé mechanizmy. 6. Geny, genomika. Struktura chromozomu, chromatin. 7. DNA polymerasy, přehled, funkce, vlastnosti.
|
| Studijní aktivity a metody výuky |
| Přednášení, Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming) |
| Výstupy z učení |
|
Přednáška se zabývá nukleosidy, nukleotidy a nukleovými kyselinami z chemického a molekulárně-biologického pohledu. Je vhodná zejména pro studenty na rozhraní oborů organická chemie, bioorganická chemie, molekulární a chemická biologie.
Umět nalézt propojení mezi obory organické chemie, biochemie a molekulární biologie a využít toho k řešení problémů a odhalování mechanizmů reakcí probíhajících v živých organizmech. |
| Předpoklady |
|
nespecifikováno
|
| Hodnoticí metody a kritéria |
|
Ústní zkouška
1. Doporučuje se pravidelná docházka. 2. V druhé části semestru si každý student připraví zhruba 20 min přednášku na jím zvolené téma z oblasti týkající se jakýmkoliv způsobem nukleových kyselin. 3. Samotná zkouška bude provedena ústní formou na závěrečné hodině, bude se jednat o vzájemnou diskusi k problematice NK a v hodnocení bude zahrnuta i kvalita studentovy přednášky (bod 2). V případě nesplnění předchozích požadavků bude zkouška udělována na základě písemného testu s požadavkem zisku alespoň 50 % bodů |
| Doporučená literatura |
|
| Studijní plány, ve kterých se předmět nachází |
| Fakulta | Studijní plán (Verze) | Kategorie studijního oboru/specializace | Doporučený semestr | |
|---|---|---|---|---|
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Bioorganická chemie a chemická biologie (2020) | Kategorie: Chemické obory | 1 | Doporučený ročník:1, Doporučený semestr: Zimní |
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Organická chemie (2021) | Kategorie: Chemické obory | 1 | Doporučený ročník:1, Doporučený semestr: Zimní |