| Název předmětu | Chemická biologie 1 |
|---|---|
| Kód předmětu | OCH/CB1 |
| Organizační forma výuky | Přednáška |
| Úroveň předmětu | Magisterský |
| Rok studia | nespecifikován |
| Semestr | Letní |
| Počet ECTS kreditů | 4 |
| Vyučovací jazyk | Čeština |
| Statut předmětu | Povinný |
| Způsob výuky | Kontaktní |
| Studijní praxe | Nejedná se o pracovní stáž |
| Doporučené volitelné součásti programu | Není |
| Vyučující |
|---|
|
| Obsah předmětu |
|
1. Chemická biologie - úvod, definice oboru, přehled a historie 2. Návrhy knihoven chemických látek pro screening biologických aktivit. Potřebná infrastruktura, vysokokapacitní screening, technologie 3. Afinitní chromatografie, protilátky, imunoprecipitace 4. Práce s chemickými a biologickými databázemi, data mining, softwarové nástroje pro analýzu dat z vysokokapacitního testování 5. Exprese genů, kontrola, genové reportéry, luciferáza, luminiscenční technologie v mapování buněčných drah, fluorescence, fluorescenční proteiny a jejich aplikace v chemické biologii. 6. Proteomika, úvod do metodiky; proteom, biomarkery, separační a identifikační metody 7. Analýza obrazu, high-content analýza, non label technologie, machine learning, interpretace v souvislosti se SAR. 8. siRNA, shRNA, návrhy, optimalizace, příprava, principy využití v hledání cílů malých molekul 9. Enzymatické a biochemické testy, enzymová kinetika 10. In situ click chemie a HALO proteiny, kovalentní chemické interakce jako analogie interakce protilátka - protein. 11. Hodnocení interakcí na úrovni jednotlivých molekul - FRET, kolokalizace AFM, SNOM, SELEX, aptamery, superrozlišení, biomolekulární interakce - SPR, yeast two hybrid, ChiP. 12. Journal club
|
| Studijní aktivity a metody výuky |
| Přednášení, Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming) |
| Výstupy z učení |
|
Seznámit studenta se základními aplikacemi v oblasti chemické biologie ve vývoji léčiv. Naučit jej pracovat s informačními zdroji a databázemi chemické biologie. Vysvětlit klíčové metodické přístupy využitelné v testování chemických knihoven a dalších biologických experimentech.
Porozumnění biologickým procesům na molekulární úrovni a teoretický základ moderních metod využívaných v oboru chemická biologie |
| Předpoklady |
|
nespecifikováno
|
| Hodnoticí metody a kritéria |
|
Ústní zkouška, Seminární práce
Znalosti v rozsahu probírané látky (sylabus) a doporučené literatury. |
| Doporučená literatura |
|
| Studijní plány, ve kterých se předmět nachází |
| Fakulta | Studijní plán (Verze) | Kategorie studijního oboru/specializace | Doporučený semestr | |
|---|---|---|---|---|
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Bioorganická chemie a chemická biologie (2020) | Kategorie: Chemické obory | 1 | Doporučený ročník:1, Doporučený semestr: Letní |