Předmět: Biosyntéza a biomimetická syntéza přírodních látek

» Seznam fakult » PRF » OCH
Název předmětu Biosyntéza a biomimetická syntéza přírodních látek
Kód předmětu OCH/BBS
Organizační forma výuky Přednáška
Úroveň předmětu Magisterský
Rok studia nespecifikován
Semestr Letní
Počet ECTS kreditů 3
Vyučovací jazyk Čeština
Statut předmětu Povinně-volitelný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Pospíšil Jiří, doc. PhD.
Obsah předmětu
Přednáška č. 1 a 2 Úvod do biosyntézy, primární metabolismus a sekundární metabolity, metabolismus a strukturní rozmanitost v oblasti přírodních látek Přednáška č. 3 a 4 Koenzymy a Šikimátová dráha. Úvod do sekundárních metabolitů. Přednáška č. 5 a 6 Biosyntéza a biomimetická syntéza alkaloidů Přednáška č. 7 a 8 Biosyntéza a biomimetická syntéza mastných kyselin a polyketidů Přednáška č. 9 a 10 Biosyntéza a biomimetická syntéza isoprenoidů Přednáška č. 11 a 12 Biosyntéza a biomimetická syntéza fenylpropanoidů a jejich dimerů a oligomerů Přednáška č. 13 "The Art of total synthesis" Aplikace biomimetického přístupu při syntéze komplexních přírodních látek

Studijní aktivity a metody výuky
Přednášení, Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming)
  • Účast na výuce - 2 hodiny za semestr
Výstupy z učení
Cílem předmětu je představit studentům stručný přehled primárního metabolismu, enzymatických reakcí a chemie kofaktorů při enzymatických reakcích a ukázka způsobu tvorby hlavních tříd sekundárních metabolitů: šikimátové deriváty, alkaloidy, mastné kyseliny, polyketydy a isoprenoidy. V mnoha případech porozumění jednotlivým reakčním krokům z mechanistického hlediska organické chemie umožnilo navrhnout lepší modely popisující metabolické cesty a enzymatické reakce. Stejným způsobem izolace a strukturní určení izolovaných sekundárních metabolitů se zajímavými biologickými vlastnostmi vedlo k navržení nových reakčních metod, katalyzátorů či sekvencí, které "imitují" různé enzymatické reakce či metabolické dráhy. Biomimetický přístup v syntéze komplexních organických látek tak imituje enzymatické a neenzymatické transformace využívané při biosyntéze metabolitů a jejich derivátů. Cílem je ukázat studentům, že naše porozumění reakčním mechanismům mnoha z těchto biotransformací nám umožnilo navrhnout nové katalyzátory/reagenty, které nám umožnily připravit jak tyto přírodní produkty, jejich syntetické deriváty tak i látky pouze vzdáleně strukturně podobné přírodním látkám.
Získané způsobilosti - Rozpoznat a řadit přírodní látky podle jejich hlavních tříd - Uvědomit si biologický a chemický původ těchto látek - Navrhnout pravděpodobný mechanismu vzniku u mnohých z těchto látek - Pochopit úskalí plynoucí z biomimetického přístupu při syntéze přírodních látek
Předpoklady
U studenta se vyžaduje znalost ze základních přednášek z organické, anorganické a fyzikální chemie.

Hodnoticí metody a kritéria
Známkou, Ústní zkouška, Seminární práce

Zápočet bude udělen za vypracování seminární práce (viz níže). Seminární práce musí být odevzdána minimálně 7 dní před ústní zkouškou. Seminární práce (maximum 5 stran A4, Times New Roman 11, řádkování 1.1; včetně obrázků, schémat a použité literatury) bude založena na analýze syntézy přírodní molekuly (molekula převzata z literatury - molekuly vybrány přednášejícím) s hlavním důrazem na mechanismus a selektivitu klíčových reakcí. V průběhu ústní zkoušky bude tato práce sloužit jako základ pro zkoušku. Otázky se tak budou odvíjet od seminární práce, ale nebudou na ni OMEZENA. Podrobná diskuze jednotlivých syntetických transformací pak bude základem pro hodnocení studentů.
Doporučená literatura
  • A. E. Osbourn, V. Lanzotti ed. (2009). Plant-derived natural products : synthesis, function, and application. Dordrecht, Springer.
  • L. Macholán. (2013). Sekundární metabolity. Masarykova univerzita v Brně.
  • Rajesh Arora ed. (2010). Medicinal plant biotechnology. Cambridge, CABI.
  • Z. Vodrážka. (1996). Biochemie. Academia Praha, Praha.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Bioorganická chemie a chemická biologie (2020) Kategorie: Chemické obory 1 Doporučený ročník:1, Doporučený semestr: Letní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Organická chemie (2021) Kategorie: Chemické obory 1 Doporučený ročník:1, Doporučený semestr: Letní