|
Vyučující
|
-
Berka Karel, prof. RNDr. Ph.D.
-
Bazgier Václav, Ing. Mgr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
1. Operační systém Linux - základy ovládání, příkazová řádka 2. Skriptování v BASHi, princip pipeline 3. Výpočty na clusteru, architektura. Princip výpočtu 4. Programovací jazyk Python, knihovny rdkit a jiné 5. Práce s daty v jazyce R 6. Chemické výpočty v cloudu
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž)
- Příprava na zápočet
- 60 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
Cílem předmětu je seznámit studenty se základními technickými požadavky nutnými pro studium výpočetní chemie. Součástí kurzu bude práce s open-source operačním systémem Linux a základy programování v jazyce Python a R. Profilaci studentů pro práci s chemickými výpočty pak zaručí výuka chemických výpočtů na clusteru a v cloudu, stejně jako osvojení práce s online knihovnami a databázemi.
Ovládat osobní počítač, připravit softwarové nástroje k danému účelu
|
|
Předpoklady
|
nespecifikováno
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Písemná zkouška
Účast na seminářích minimálně 80 %, samostatná realizace zadného projektu.
|
|
Doporučená literatura
|
-
Kameník Pavel. Příkazový řádek v Linuxu. 2021.
-
Pecinovský Rudolf. Začínáme programovat v jazyku Python. 2022.
|