Předmět: Programování pro chemiky

» Seznam fakult » PRF » KFC
Název předmětu Programování pro chemiky
Kód předmětu KFC/PPCH
Organizační forma výuky Přednáška + Cvičení
Úroveň předmětu Magisterský
Rok studia nespecifikován
Semestr Zimní
Počet ECTS kreditů 2
Vyučovací jazyk Čeština
Statut předmětu Povinně-volitelný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Berka Karel, doc. RNDr. Ph.D.
  • Bazgier Václav, Ing. Mgr. Ph.D.
Obsah předmětu
1. Operační systém Linux - základy ovládání, příkazová řádka 2. Skriptování v BASHi, princip pipeline 3. Výpočty na clusteru, architektura. Princip výpočtu 4. Programovací jazyk Python, knihovny rdkit a jiné 5. Práce s daty v jazyce R 6. Chemické výpočty v cloudu

Studijní aktivity a metody výuky
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž)
  • Příprava na zápočet - 60 hodin za semestr
Výstupy z učení
Cílem předmětu je seznámit studenty se základními technickými požadavky nutnými pro studium výpočetní chemie. Součástí kurzu bude práce s open-source operačním systémem Linux a základy programování v jazyce Python a R. Profilaci studentů pro práci s chemickými výpočty pak zaručí výuka chemických výpočtů na clusteru a v cloudu, stejně jako osvojení práce s online knihovnami a databázemi.
Ovládat osobní počítač, připravit softwarové nástroje k danému účelu
Předpoklady
nespecifikováno

Hodnoticí metody a kritéria
Písemná zkouška

Účast na seminářích minimálně 80 %, samostatná realizace zadného projektu.
Doporučená literatura


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Aplikovaná chemie (2022) Kategorie: Chemické obory 2 Doporučený ročník:2, Doporučený semestr: Zimní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Nanomateriálová chemie (2024) Kategorie: Chemické obory 2 Doporučený ročník:2, Doporučený semestr: Zimní