|
Vyučující
|
-
Berka Karel, doc. RNDr. Ph.D.
-
Jurečka Petr, doc. RNDr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
Struktura vody a její atypické vlastnosti, významné pro vznik a existenci života, jsou určeny nekovalentními interakcemi. Prakticky všechny procesy v živém prostředí jsou od začátku až do konce jednoznačně určeny nekovalentními interakcemi. Struktura biomakromolekul (DNA a bílkoviny), daná koexistencí vodíkových vazeb, elektrostatických, dispersních, repulsních a hydrofobních příspěvků určuje jednoznačně jejich funkci. 1. Původ a popis nekovalentních interakcí, srovnání kovalentních a nekovalentních interakcí 2. Experimentální detekce nekovalentních interakcí 3. Kvantověchemické a statistickothermodynamické určení nekovalentních interakcí; statický a dynamický pohled 4. Počítačové experimenty: metody molekulové dynamiky a Monte Carlo 5. Nekovalentní interakce v chemii a fyzice 6. Energie, enthlapie, entropie, volná energie; hydrofobní interakce 7. Vodíkové vazby; nepravé vodíkové vazby; dvouvodíkové vazby 8. Mezimolekulové komplexy v plynné fázi 9. Úloha kapalné fáze a struktura nekovalentních komplexů v kapalném prostředí 10. Nekovalentní interakce v biodiscilínách 11. Struktura a funkce basí, párů basí a oligomerů nukelových kyselin; struktura a funkce DNA a komplexů DNA s léčivy a cizorodými látkami 12. Struktura a funkce bílkovin; sbalování bílkovin 13. Interakce bílkovin s léčivy, inhibitory a cizorodými látkami; navrhování a modelování nových léčiv
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž)
- Příprava na zkoušku
- 90 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
Předmět je zaměřen na nekovalentní interakce vedoucí ke tvorbě mezimolekulových komplexů hrají významnou úlohu v chemii a fyzice a naprosto klíčovou úlohu v biodisciplínách.
Definovat hlavní pojmy, popsat nekovalentní interakce a jejich vztah k biodisciplínám
|
|
Předpoklady
|
nespecifikováno
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Ústní zkouška
|
|
Doporučená literatura
|
-
Hobza P., Havlas Z. (2000). Blue-Shifting Hydrogen Bonds. Chem. Rev. 100, 4253.
-
Hobza P., Šponer J. (1999). Structure, Energetics, and Dynamics of the Nucleic Acid Base Paris. Chem. Rev. 99, 3247.
-
Hobza P., Zahradník R. (1988). Intermolecular Interactions between Medium-Sized Systems. Chem. Rev. 88, 871.
-
Hobza P., Zahradník R. (1988). Mezimolekulové komplexy. Academia Praha.
-
Mueller-Dethlefs K., Hobza P. (2000). Noncovalent Interactions: A Challenge for Experiment and Theory. Chem. Rev. 100, 143.
|