Předmět: Cvičení z molekulového modelování

» Seznam fakult » PRF » KFC
Název předmětu Cvičení z molekulového modelování
Kód předmětu KFC/CMO
Organizační forma výuky Cvičení
Úroveň předmětu Magisterský
Rok studia nespecifikován
Semestr Letní
Počet ECTS kreditů 3
Vyučovací jazyk Čeština
Statut předmětu Povinně-volitelný, Volitelný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Berka Karel, doc. RNDr. Ph.D.
  • Kührová Petra, Mgr. Ph.D.
  • Zgarbová Marie, Mgr. Ph.D.
Obsah předmětu
1. Popis geometrie molekul, konverze - Babel 2. Single point výpočet 3. Optimalizace geometrie 4. Frekvenční analýza a termodynamika 5. Povrch potenciální energie 6. Reakční koordináta 7. Biomakromolekuly a empirické potenciály 8. Molekulová dynamika

Studijní aktivity a metody výuky
Nácvik pohybových a pracovních dovedností
  • Semestrální práce - 150 hodin za semestr
Výstupy z učení
Cílem předmětu je získání praktických dovednosti z oblastí molekulového modelování, zejména provedení kvantově-chemických a molekulárně dynamických výpočtů.
aplikovat základní postupy a metody molekulového modelování, zvládnout kvantově-chemické a molekulárně dynamické výpočty
Předpoklady
nespecifikováno

Hodnoticí metody a kritéria
Seminární práce

Doporučená literatura
  • Foresman J.B., Frisch A. Exploring Chemistry with Electronic Structure Methods.
  • Leach A. R. (2001). Molecular modelling. Prentice Hall, London.
  • Remko M. Molekulove modelovanie.
  • Young D. Computational Chemistry, A Practical Guide for Applying Techniques to Real World Problems..


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Bioinformatika (2021) Kategorie: Informatické obory - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Fyzikální chemie (2021) Kategorie: Chemické obory 1 Doporučený ročník:1, Doporučený semestr: Letní