|
Vyučující
|
-
Bělíček Jakub, Mgr.
-
Kopečný David, Mgr. Ph.D.
-
Jorda Radek, Mgr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
Úvod do předmětu (biomolekuly, jejich rozdělení, typy interakcí, přehled metod založených na sledování interakce proteinů s malými molekulami); řešení interakcí spjatých se stanovením struktury makromolekul (rentgenová krystalografie, nukleární magnetická resonance, kryo-elektronové mikroskopie, optická rotační disperze a cirkulární dichroismus); termoforéza v malém měřítku; rezonance povrchového plasmonu; kalorimetrie (izotermální titrační kalorimetrie, diferenciální skenovací kalorimetrie); diferenční skenovací fluorimetrie a její varianty i v buněčných systémech, Försterův rezonanční přenos energie (FRET, BRET); kinasová selektivita a metody její stanovení; interpretace a vyhodnocení dat (porozumění grafů, spekter, křivek či konstant).
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
|
Přednášení
|
|
Výstupy z učení
|
Studenti získávají informace o metodách studia struktur a stability makromolekul a o metodách studia interakcí mezi dvojicemi ligand-protein nebo protein-nukleová kyselina.
Prohloubení znalostí moderních metod biochemie a strukturní biologie se zaměřením na metody studia interakcí s makromolekulami.
|
|
Předpoklady
|
Předmět je určen studentům chemických a biologických oborů včetně těch, které mají přesah do obou disciplín, např. Experimentální biologie nebo Bioorganická chemie a chemická biologie. Podmíněnost absolvování tohoto předmětu je předchozí úspěšné absolvování zkoušky z biochemie a fyzikální chemie.
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Ústní zkouška
Úspěšné složení ústní zkoušky.
|
|
Doporučená literatura
|
-
Nordén, B., Rodger, A., Dafforn, T. (2010). Linear Dichroism and Circular Dichroism: A Textbook on Polarized-Light Spectroscopy. Cambridge.
-
Serdyuk, I. N., Nathan R., Zaccai, J. (2007). Methods in Molecular Biophysics : Structure, Dynamics, Function. Cambridge.
-
Slabý, O. et al. (2015). Molekulární medicína. Galén.
-
Waseda, Y., Matsubara, E., Shinoda, K. (2011). X-ray Diffraction Crystallography. Heidelberg.
|