| Název předmětu | Fundamentals of Proteomics |
|---|---|
| Kód předmětu | KBI/ZPEN |
| Organizační forma výuky | Přednáška + Seminář |
| Úroveň předmětu | Bakalářský |
| Rok studia | nespecifikován |
| Semestr | Letní |
| Počet ECTS kreditů | 5 |
| Vyučovací jazyk | Angličtina |
| Statut předmětu | Volitelný |
| Způsob výuky | Kontaktní |
| Studijní praxe | Nejedná se o pracovní stáž |
| Doporučené volitelné součásti programu | Není |
| Vyučující |
|---|
|
| Obsah předmětu |
|
1. Introdution to proteomics, definition, history, application of proteomics in biological experiments, advantages, limitations, top-down and bottom-up approaches 2. Application of proteomics in biological experiments: developmental proteomics, proteomics of stress response, proteomics of mutants, organelle proteomics, clinical proteomics 3. The workflow of proteomic analysis, overview on proteomic methods 4. Sample preparation ? principles of protein sample handling, homogenization, protein solubilisation, precipitation, fractionation, detergents 5. Two-dimensional electrophoresis ? principle, application, isoelectric focusing with demonstration, polyacrylamide electrophoresis, protein staining, 6. Two-dimensional electrophoresis-gel documentation, software analysis, profiling 7. Gel-free proteomic analyses: principles, peptide separation, 8. Protein dugextion theory, principles, peptide separation 9. Introduction into mass spectrometry: theory, demonstration of mass spectrometer 10. Introduction into the interpretation and evaluation of proteomic data 11. Posttranslational modification of proteins: theory, detection using proteomic methods 12. Protein phosphorylation: principles, importance, phosphoproteomics
|
| Studijní aktivity a metody výuky |
| Přednášení, Metody práce s textem (učebnicí, knihou) |
| Výstupy z učení |
|
Získání základních znalostí z oboru proteomiky.
Students will gain an overview of basic concepts in proteomics, the methods used in proteomics, and the applications of proteomics in biotechnology. They will also become familiar with different strategies of proteomic analysis. |
| Předpoklady |
|
nespecifikováno
|
| Hodnoticí metody a kritéria |
|
Písemná zkouška
Completion and regular presentation of all tasks given by the lecturer. 100% attendance on seminars. Successful completion of a written exam in the form of a test with a minimum score of 65%. |
| Doporučená literatura |
|
| Studijní plány, ve kterých se předmět nachází |
| Fakulta | Studijní plán (Verze) | Kategorie studijního oboru/specializace | Doporučený semestr | |
|---|---|---|---|---|
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Biotechnologie a genové inženýrství (2026) | Kategorie: Chemické obory | - | Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Letní |