| Název předmětu | Základy proteomiky |
|---|---|
| Kód předmětu | KBI/ZPA |
| Organizační forma výuky | Přednáška + Seminář |
| Úroveň předmětu | Bakalářský |
| Rok studia | nespecifikován |
| Semestr | Letní |
| Počet ECTS kreditů | 5 |
| Vyučovací jazyk | Čeština |
| Statut předmětu | Povinný |
| Způsob výuky | Kontaktní |
| Studijní praxe | Nejedná se o pracovní stáž |
| Doporučené volitelné součásti programu | Není |
| Vyučující |
|---|
|
| Obsah předmětu |
|
1. Úvod do proteomiky, vymezení pojmu, historie, aplikace proteomiky v řešení biologických problémů: výhody, omezení, top-down a bottom-up přístupy 2. Aplikace proteomiky v řešení biologických problémů: vývinová proteomika, proteomika stresem ovlivněných organizmů, proteomika mutantů, proteomika organel, klinická proteomika 3. Průběh proteomické analýzy, přehled proteomických metod 4. Příprava vzorku pro proteomické analýzy - zásady při práci s bílkovinami, homogenizace, solubilizace bílkovin, precipitace, frakcionace, detergenty 5. Dvourozměrná elektroforéza - princip, aplikace, izoelektrická fokusace na stripech s praktickou demonstrací, polyakrylamidová elektroforéza, metody detekce proteinů na gélech 6. Dvourozměrná elektroforéza - dokumentace, softverové vyhodnocení, profiling 7. Bezgelové proteomické analýzy - MuDPiT: principy, separace peptidů 8. Štěpení proteinů: teorie, zásady, metody 9. Úvod do hmotnostní spektrometrie: teorie, demonstrace hmotnostního spektrometru, 10. Úvod do interpretace a vyhodnocení proteomických dat 11. Posttranslační modifikace bílkovin: teorie, možnosti proteomické detekce 12. Fosforylace proteinů: princip, úlohy, fosfoproteomika Během budou prezentovány praktické aplikace učiva z přednášek. Důraz bude kladen na orientaci studentů v proteomické literatuře. Studenti demonstrují své znalosti formou prezentace úkolů.
|
| Studijní aktivity a metody výuky |
Přednášení, Metody práce s textem (učebnicí, knihou)
|
| Výstupy z učení |
|
Získání základních znalostí z oboru proteomiky.
Studenti získají přehled o základních pojmech v proteomice, metodách využívaných v proteomice, a využití proteomiky v biotechnologiích. Také budou mít přehled v různých strategiích proteomické analýzy. |
| Předpoklady |
|
nespecifikováno
|
| Hodnoticí metody a kritéria |
|
Písemná zkouška
|
| Doporučená literatura |
|
| Studijní plány, ve kterých se předmět nachází |
| Fakulta | Studijní plán (Verze) | Kategorie studijního oboru/specializace | Doporučený semestr | |
|---|---|---|---|---|
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Biotechnologie a genové inženýrství (2022) | Kategorie: Chemické obory | 2 | Doporučený ročník:2, Doporučený semestr: Letní |