| Název předmětu | Biotechnologické a biochemické informace |
|---|---|
| Kód předmětu | KBI/BTIA |
| Organizační forma výuky | Seminář |
| Úroveň předmětu | Bakalářský |
| Rok studia | nespecifikován |
| Semestr | Letní |
| Počet ECTS kreditů | 2 |
| Vyučovací jazyk | Angličtina |
| Statut předmětu | Povinný |
| Způsob výuky | Kontaktní |
| Studijní praxe | Nejedná se o pracovní stáž |
| Doporučené volitelné součásti programu | Není |
| Vyučující |
|---|
|
| Obsah předmětu |
|
První část cyklu seminářů bude zaměřena na práci s odbornou literaturou a literárními zdroji. Základní pojmy. Elektronické informační zdroje a jejich typy (bibliografické, plnotextové a hybridní; multioborové a specializované; volně dostupné a placené). Základy rešeršní strategie a tvorby rešeršního dotazu (klíčové slova, autor). Práce s výsledky vyhledávání - evaluace, třídění, export, získávání primárních dokumentů. Vybrané multioborové, specializované a citační databáze (PubMed, Web of Science, Biological Abstracts, Current Contens, JCR). Plnotextové databáze (Science Direct, SpringerLink). Základní pravidla pro praktické využití literárních zdrojů při přípravě vědecké publikace. Druhá část série seminářů bude věnována základním principům práce a vyhledávání informací v sekvenčních databázích NCBI (nucleotide BLAST, protein BLAST), jejích interpretaci a praktickému využití v biotechnologickém výzkumu. Srovnání sekvencí nukleových kyselin a proteinů, vyhledávání genů, identifikace proteinových domén. Forma seminářů - po úvodních teoretických přednáškách budou studenti samostatně řešit zadané problémové úkoly. Syllabus Topic 1. Introduction to BTI course. Topic 2. Searching engines and biological databases. Topic 3. Literature and citation tools. Topic 4. Science social networking and scientometrics. Topic 5. Types and structure of research papers. Basics of academic writing. Topic 6. Intro to biometry and biomedical statistics. Topic 7. Artificial intelligence (AI) applications in biology. Topic 8. DNA databases. Topic 9. Protein databases. Topic 10. Protein structure prediction and molecular docking. Topic 11. Biodiversity databases and databases of model organisms. Topic 12. Microscope image processing and presentation.
|
| Studijní aktivity a metody výuky |
| nespecifikováno |
| Výstupy z učení |
|
Seznámení se s různými aspekty využívání informací pro studium a vědeckou práci v oblasti biotechnologií se zaměřením na on-line informační zdroje.
Po absolvování seminářů budou studenti schopni pracovat s vybranými multioborovými i specializovanými databázemi, sestavit rešeršní dotaz, pracovat s výsledky vyhledávání, získat plné texty primárních dokumentů a použít je při přípravě vědecké publikace. Rovněž budou schopni získat a interpretovat základní informace ze sekvenčních databází. |
| Předpoklady |
|
nespecifikováno
|
| Hodnoticí metody a kritéria |
|
nespecifikováno
Pravidelná účast na seminářích, vypracování zadaných individuálních úkolů. |
| Doporučená literatura |
|
| Studijní plány, ve kterých se předmět nachází |
| Fakulta | Studijní plán (Verze) | Kategorie studijního oboru/specializace | Doporučený semestr | |
|---|---|---|---|---|
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Biotechnologie a genové inženýrství (2022) | Kategorie: Chemické obory | 2 | Doporučený ročník:2, Doporučený semestr: Letní |