Předmět: Bioimaging rostlinných buněk

» Seznam fakult » PRF » KBI
Název předmětu Bioimaging rostlinných buněk
Kód předmětu KBI/BRB
Organizační forma výuky Přednáška + Cvičení
Úroveň předmětu Magisterský
Rok studia nespecifikován
Semestr Zimní
Počet ECTS kreditů 3
Vyučovací jazyk Čeština, Angličtina
Statut předmětu Povinně-volitelný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Dostupnost předmětu Předmět je nabízen přijíždějícím studentům
Vyučující
  • Ovečka Miroslav, prof. Mgr. Ph.D.
Obsah předmětu
Praktická aplikace pokročilých metod světelné mikroskopie, využití DIC při studiu živých nebarvených preparátů, videomikroskopie a snímání dynamických dějů pomocí různých typů kamer. Fluorescenční mikroskopie, dokumentace a softvarová úprava kvality zašumění obrazu pomocí dekonvoluce. Konfokální laserová skenovací mikroskopie a její praktické aplikace při studiu rostlinných buněk. Pokročilé metody studia fluorescenčně značených epitopů v živých rostlinných buňkách, kolokalizace, spektrální analýza, FRAP, FLIP, FRET, fyziologická měření. Snímání rychlých buněčných procesů v reálním čase pomocí konfokální mikroskopie s rotujícím diskem, praktická analýza a vyhodnocení dynamiky dějů, probíhajících v živých rostlinných buňkách. 1. Světelná mikroskopie, snímání rychlých dějů v živých rostlinných buňkách metodami modulace kontrastu a videomikroskopie. 2. Fluorescenční mikroskopie, dekonvoluce a její aplikace při snímání fluorescenčně značených objektů. 3. Konfokální laserová skenovací mikroskopie, způsoby multikanálového snímání, časosběrné snímání a 3D rekonstrukce. 4. Konfokální laserová skenovací mikroskopie, determinace mobility a stability fluorescenčně značených epitopů metodami kolokalizace, FRAP a FLIP. 5. Konfokální laserová skenovací mikroskopie, studium interakcí epitopů pomocí FRET. 6. Konfokální laserová skenovací mikroskopie, spektrální charakterizace fluorochromů a separace emisních spekter. 7. Konfokální laserová skenovací mikroskopie, fyziologické studie stanovením nitrobuněční distribuce a koncentrace molekul. 8. Konfokální mikroskopie s rotujícím diskem, princip metody, příprava preparátů pro live cell imaging a snímání rychlých buněčných procesů. 9. Konfokální mikroskopie s rotujícím diskem, snímání struktury fluorescenčně značeného cytoskeletu rostlinných buněk. 10. Konfokální mikroskopie s rotujícím diskem, snímání dynamického pohybu fluorescenčně značených organel v rostlinných buňkách. 11. Konfokální mikroskopie s rotujícím diskem, vyhodnocování dat o struktuře a pohyblivosti cytoskeletálních a membránových buněčných struktur. 12. Konfokální mikroskopie s rotujícím diskem, multikanálová mikroskopie rychlých dějů v živých rostlinných buňkách.

Studijní aktivity a metody výuky
Demonstrace, Laborování
Výstupy z učení
Získání obsáhlých praktických zkušeností s aplikacemi moderních metod světelné, fluorescenční a laserové mikroskopie rostlinných buněk
Obeznámení se s principem moderních metod neinvazivní mikroskopie a jejich praktická aplikace na rostlinných buňkách
Předpoklady
nespecifikováno

Hodnoticí metody a kritéria
Seminární práce

Účast a vypracování protokolů z experimentálních úkolů
Doporučená literatura
  • Conn PM . (2010). Techniques in confocal microscopy. Elsevier Academic Press.
  • Cox G. (2012). Optical imaging techniques in cell biology. CRC Press, Boca Raton .
  • Goldman, R. D., Swedlow, J. R., & Spector, D. L. (2010). Live cell imaging : a laboratory manual . Cold Spring Harbor, N.Y: Cold Spring Harbor Laboratory.
  • Price RL, Jerome WG. (2010). Basic confocal microscopy. Springer, Heidelberg.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biotechnologie a genové inženýrství (2019) Kategorie: Chemické obory 1 Doporučený ročník:1, Doporučený semestr: Zimní