|
Vyučující
|
-
Kašpárková Jana, prof. RNDr. Ph.D.
-
Brabec Viktor, prof. RNDr. DrSc.
|
|
Obsah předmětu
|
1. Úvod: Vymezení obsahu a definice molekulární biofyziky. Mezimolekulární síly. Termodynamika přeměn v biologických systémech - stručný přehled. 2. Struktura a funkce nukleových kyselin: Struktura monomerních složek nukleových kyselin. Primární a sekundární struktura DNA. Stabilita DNA. Kruhová DNA. 3. Neobvyklé struktury nukleových kyselin. Nukleázy. 4. Struktura a vlastnosti chromozomu. 5. Replikace DNA. 6. "Svět RNA". Typy RNA a struktura. Transkripce a translace. 7. Katalytická aktivita nukleových kyseliny - ribozymy a deoxyribozymy. Molekulární evoluce a "svět RNA". Aptamery. 8. Využití elektrochemie ke studiu struktury nukleových kyselin 9. Struktura a funkce bílkovin: Funkce bílkovin. Složení bílkovin, struktura a vlastnosti aminokyselin, konfigurace peptidické vazby. Primární, sekundární, terciární struktura bílkovin, síly stabilizující strukturu bílkovin, kvarterní struktura. 10. Proteiny vážící se na DNA, jejich sekundární struktury. Vliv teploty a pH na strukturu bílkovin. Chaperony, chaperoniny. 11. Struktura a funkce ostatních biopolymerů: Sacharidy-funkce sacharidů, typy sacharidů. Monosacharidy - struktura, konformace, optická aktivita. Polysacharidy - konformace glykosidické vazby. Glykoproteiny. Příklady a funkce polysacharidů. 12. Lipidy - složení, vztah mezi fyzikálními vlastnostmi a strukturou. Složené lipidy, steroly. Biofyzikální vlastnosti biologicky významných lipidů. Fyzikální vlastnosti olejů a tuků (vliv dvojných vazeb na strukturu).
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Přednášení
- Účast na výuce
- 26 hodin za semestr
- Příprava na zkoušku
- 80 hodin za semestr
- Domácí příprava na výuku
- 10 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
Vymezení obsahu a definice molekulární biofyziky.Molekulární biofyzika buněčných membrán.
Předmět zaměřený na získání znalostí. Definovat hlavní pojmy, popsat hlavní přístupy, prokázat teoretické znalosti pro řešení modelových problémů.
|
|
Předpoklady
|
Základní znalosti z biochemie.
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Známkou
Znalosti v rozsahu sylabu předmětu.
|
|
Doporučená literatura
|
-
Alberts, B., Bray, D., Johnson, A., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K., Walter, P. (2000). Základy buněčné biologie. Espero Publishing, Ústí nad Labem.
-
Bergethon, P.R. (1998). The Physical Basis of Biochemistry. The Foundations of Molecular Biophysics. Springer.
-
Kodíček, M., Karpenko, V. (2000). Biofyzikální chemie. Academia Praha.
-
Tuszynski, J.A., Kurzynski, M. (2003). Introduction to Molecular Biophysics. CRC Press, Washington, DC.
|