Předmět: Experimentální metody biofyziky

» Seznam fakult » PRF » KBF
Název předmětu Experimentální metody biofyziky
Kód předmětu KBF/PGSEB
Organizační forma výuky Konzultace
Úroveň předmětu Doktorský
Rok studia nespecifikován
Semestr Zimní a letní
Počet ECTS kreditů 20
Vyučovací jazyk Čeština, Angličtina
Statut předmětu nespecifikováno
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Lazár Dušan, prof. RNDr. Ph.D.
  • Prasad Ankush, Mgr. Ph.D.
  • Herbst Christian, MgA. Ph.D.
  • Nauš Jan, prof. RNDr. CSc.
  • Ilík Petr, prof. RNDr. Ph.D.
  • Pospíšil Pavel, prof. RNDr. Ph.D.
  • Brabec Viktor, prof. RNDr. DrSc.
  • Kašpárková Jana, prof. RNDr. Ph.D.
  • Švec Jan, prof. RNDr. Ph.D. et Ph.D.
  • Kubala Martin, doc. RNDr. Ph.D.
Obsah předmětu
Nativní a denaturační elektroforéza proteinů a pigment-proteinových komplexů. Gel skenery a zobrazování. HPLC fotosyntetických pigmentů. Metody EPR, spin-rapping, spin-labelling, elektronové spinové echo, opticky detekovaná magnetická rezonance, metoda ENDOR. Lineární a cirkulární dichroismus. FTIR a rezonanční Ramanova spektroskopie. Fotoakustická spektroskopie. Gazometrické metody. Kinetika luminiscencí, termoluminiscence a chemiluminiscence, biofotonová emise. Mikroskopie atomárních sil, blízkého pole a STM. Optické nůžky, mikromanipulace s molekulami. Fluorescenční mikroskopie a fluorescenční zobrazovací metody (imaging). Instrumentální technika pro fluorescenční spektroskopii, měření dob života excitovaného stavu v časové a frekvenční doméně, efekty solventu, reakce v excitovaném stavu, zhášení fluorescence, anizotropie fluorescence, FRET, autofluorescence proteinů. Chromatografie (HPLC) při studiu biopolymerů. Elektroforéza DNA a proteinů. Metody molekulární biofyziky při studiu modifikací DNA biologicky významnými agens: vazba na DNA, stanovení meziřetězcových můstků, úhlu rozvinutí doušrobovice, využití chemických sond konformace DNA, metody studia interakce proteinů s DNA, metody studia oprav DNA in vitro a in vivo. Metody cytometrie s vysokým rozlišením. Ramanova optická aktivita (ROA). Vibrační spektroskopie biopolymerů: infračervená a Ramanova spektroskopie . Absorpční, LD a CD spektroskopie - principy metod a využití pro studium vlastností biopolymerů. Fluorescenční techniky - FRET a jejich využití při studiu DNA. SPM (AFM ...) pro studium biopolymerů. Faktorová analýza vibračních spekter. Kalorimetrie biopolymerů. Flowcytometrie. Experimentální metody pro vyšetřování a analýzu hlasu: Laryngoskopické metody (laryngoskopie, laryngostroboskopie, vysokofrekvenční videolaryngoskopie, videokymografie), fyziologické metody (elektroglotografie, fotoglotografie, pneumografie, pneumotachografie, měření subglotického tlaku), akustické metody (mikrofonní záznam, akustická spektrografie, hlasové pole, MDVP, DSI). Měření hlasové zátěže (hlasová dozimetrie, dávka časová, dávka kmitů a vzdálenosti, vyzářená a disipativní energie při fonaci, použití akcelerometrů pro záznam hlasu).

Studijní aktivity a metody výuky
Přednášení
Výstupy z učení
Základní poznatky z experimentálních metod biofyziky.
Předmět zaměřený na schopnost hodnocení Hodnotit konkrétní metody a postupy, vysvětlit aspekty a výsledky týkající se dané problematiky, integrovat poznatky, předpovídat řešení, hodnotit výsledky a formulovat závěry.
Předpoklady
nespecifikováno

Hodnoticí metody a kritéria
Známkou

Doporučená literatura
  • Vybrané časopisecké publikace.
  • Amesz J., Hoff A. J.(ed.). (1996). Biophysical Techniques in Photosynthesis. Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, Boston, London.
  • Baken, R. J., Orlikoff, R. F. (2000). Clinical measurement of speech and voice. San Diego, CA: Singular Publishing Group.
  • García-Campana A. M., Bayens W. R. G. (2001). Chemiluminescence in Analytical Chemistry. Marcel Dekker, Inc. New York, Basel.
  • Isenberg G.(ed.). (1998). Modern Optics, Electronics and High Precision Techniques in Cell Biology. Springer, Berlin.
  • Lakowitz, J. R. (1999). Principles of fluorescence spectroscopy (2.ed). Kluwer Academic/Plenum Publishers, New York.
  • Prosser, V. a kol. (1989). Experimentální metody biofyziky. Academia Praha.
  • Švec, J. (1996). Studium mechanicko-akustických vlastností lidského hlasu. PřF UP Olomouc.
  • Valeur, B. (2006). Molecular fluorescence. Wiley-VCH, Weinheim.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr