|
Vyučující
|
-
Frébort Ivo, prof. RNDr. CSc., Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
Bioinformatika a strukturní bioinformatika. Základy struktury proteinů. Základy struktury DNA a RNA. Určení struktury pomocí krystalografie, NMR a elektronové mikroskopie. Vizualizace molekul, databáze a interpretace dat. Porovnávání struktur. Identifikace strukturních domén proteinů. Odvozování funkce proteinů na základě struktury. Protein-protein interakce. Dokování malých ligandů do proteinových struktur. Homologní modelování. Strukturní genomika.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming)
- Příprava na zkoušku
- 50 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
Získání pokročilých znalostí v oblasti struktury nukleových kyselin a proteinů.
Hodnotit konkrétní metody a postupy strukturní bioinformatiky, vysvětlit výsledky.
|
|
Předpoklady
|
Předmět je určen studentům doktorského studia a biochemie.
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Rozhovor
Předpokládá se schopnost vést vědeckou diskuzi v širších souvislostech celého oboru.
|
|
Doporučená literatura
|
-
Bourne, P.E., Weissig, H. (2003). Structural bioinformatics. Wiley-Liss, Hobojem, NJ, USA.
|