Předmět: Cvičení molekulárně-biologické metody v diagnostice

» Seznam fakult » PRF » KBC
Název předmětu Cvičení molekulárně-biologické metody v diagnostice
Kód předmětu KBC/MBM
Organizační forma výuky Cvičení
Úroveň předmětu Magisterský
Rok studia nespecifikován
Semestr Letní
Počet ECTS kreditů 7
Vyučovací jazyk Čeština
Statut předmětu Povinný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Zalabák David, Mgr. Ph.D.
  • Škrabišová Mária, Mgr. Ph.D.
Obsah předmětu
1. Identifikace bakteriálního plasmidu pomocí restrikční analýzy (izolace plasmidu, restrikční reakce, elektroforéza v agarosovém gelu). 2. Detekce virového onemocnění SARS-CoV-2 pomocí kvantitativní PCR 3. Detekce mutantní alely lidského genu Factor V Leiden pomocí kvantitativní PCR 4. PCR genotypování T-DNA inserčních mutantů modelové rostliny Arabidopsis thaliana 5. Detekce včelích patogenů pomocí Loop-mediated isothermal amplification (LAMP

Studijní aktivity a metody výuky
nespecifikováno
Výstupy z učení
Jedná se o blokové cvičení, které tematicky navazuje na předmět Molekulárně-biologické diagnostické metody (KBC/MBDM). V rámci tohoto cvičení si studenti prakticky vyzkoušejí moderní molekulárně-biologické diagnostické metody. Cvičení je koncipováno tak, aby svým rozsahem pokrylo jak oblast diagnostiky v medicíně, rostlinné biologii a veterinární diagnostiky.

Předpoklady
nespecifikováno
KBC/MB a zároveň KBC/MBDM

Hodnoticí metody a kritéria
nespecifikováno
Doporučená literatura
  • Cooper, P. C., Rezende, S. M. (2007). An overview of methods for detection of factor V Leiden and the prothrombin G20210A mutations. Int. Jnl. Lab. Hem., 29, 153?162.
  • Liang, F. T., Steere, A. C., Marques, A. R., Johnson, B. J., Miller, J. N., Philipp, M. T. Sensitive and specific serodiagnosis of Lyme disease by enzyme-linked immunosorbent assay with a peptide based on an immunodominant conserved region of Borrelia burgdorferi vlsE. J Clin Microbiol. 1999 Dec;37(12):3990-6.
  • Magnarelli, L. A., Anderson, J. F., Barbour, A. G. Enzyme-Linked Immunosorbent Assays for Lyme Disease: Reactivity of Subunits of Borrelia burgdorferi. The Journal of Infectious Diseases, Volume 159, Issue 1, January 1989, Pages 43?49.
  • Malekshahi, A., Khanizadeh, S., Fallahi, S. et al. (2022). Diagnostic power of one-step and two-step RT-qPCR methods to SARS?CoV?2 detection. BMC Infect Dis 22, 505.
  • Notomi, T., Okayama, H., Masubuchi, H., Yonekawa, T., Watanabe, K., Amino, N., Hase, T. (2000). Loop-mediated isotherma amplification of DNA. Nucleic Acids Research, 28, 12, e63.
  • O'Malley, R. C., Barragan, C. C., Ecker, J. R. A user's guide to the Arabidopsis T-DNA insertion mutant collections. Methods Mol Biol. 2015;1284:323-42.
  • Różański, M., Walczak-Drzewiecka, A., Witaszewska, J. et al. (2022). RT-qPCR-based tests for SARS-CoV-2 detection in pooled saliva samples for massive population screening to monitor epidemics. Sci Rep 12, 8082.
  • Stepanova, A. N., Alonso, J. M. PCR-based screening for insertional mutants. Methods Mol Biol. 2006;323:163-72.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Analytický biochemik (2024) Kategorie: Chemické obory 1 Doporučený ročník:1, Doporučený semestr: Letní