|
Vyučující
|
|
|
|
Obsah předmětu
|
Nukleové kyseliny a jejich struktura. Přepis molekul DNA do RNA, typy RNA molekul, mRNA, tRNA, rRNA, malé RNA, protismyslné trankripty, definice a charakteristika genů, strukturní, regulační geny, orthologní, paralogní geny, genové rodiny, duplikace, změny počtu kopií genů, strukturní varianty genů, alternativní splicing, evoluce genů, transkripce repetitivní DNA, regulace genové exprese, RNA interference, imprinting genů, modifikace chromatinu. Sekvenování transkriptomu, vyhledávání genů a funkčních domén, nástroje predikce genů, Glimer, GeneMark, GeneScan. Analýza genové exprese, Northern blots, cDNA, microarrays, RT-PCR, SAGE, genové databáze. Validace funkce genů a funkční genomika, transformace genů a metody transgenoze, VIGS, Agrobacterium, mutageneze, TILLING, transposon tagging, TALEN.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Demonstrace
- Účast na výuce
- 26 hodin za semestr
- Příprava na zkoušku
- 35 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
Studenti se seznámí se základními i pokročilými metodami identifikace genů, sekvenování transkriptomu, analýzy genové exprese a funkční genomiky.
Po absolvování kurzu by student měl být schopen: - rozlišit a definovat různé formy genetické informace - používat nástroje pro analýzu a predikci genů - porozumět metodám ověření funkce genů a transgenoze
|
|
Předpoklady
|
Úspěšné zvládnutí požadavků bakalářského studia
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Ústní zkouška
Úspěšné složení ústní zkoušky
|
|
Doporučená literatura
|
-
Gibson, G., Muse, V.S. (2009). A Primer of Genome Science, 3. vydání. Sinauer Associates, Inc., Sunderland.
-
Gibson, G., Muse, V.S. (2004). A Primer of Genome Science. Sunderland.
-
Kahl, G., Meksem, K. (2008). The Handbook of Plant Functional Genomics. Weinheim.
-
Kole, Ch., Abbot, A.G. (2008). Principles and Practices of Plant Genomics. Enfield.
-
Ondřej M., Drobník J. (2002). Transgenoze rostlin. Akademia.
-
Pevsner, J. (2015). Bioinformatics and Functional Genomics. Wiley-Blackwell, Hoboken, New Jersey.
-
Šmarda et al. (2005). Metody molekulární biologie. Brno.
|