|
Vyučující
|
|
|
|
Obsah předmětu
|
Genetické mapování - mapování vazebné a asociační, genetické markery, mapovací populace, genetické mapování u člověka. Fyzické mapování - mapování cytogenetické, optické, mapování pomocí radiačních hybridů, fyzické kontigové mapy, mapování založené na uspořádání chromatinu. Izolace genů metodou pozičního klonování, využití syntenie. Celogenomové sekvenování - strategie a postup, sekvenační technologie druhé a třetí generace, sestavování a anotace sekvencí. Identifikace polymorfismů (SNP) a genotypizace, vysokokapacitní platformy pro analýzu genotypu. Transkriptomika - analýza transkriptomu pomocí mikročipů a sekvenování. Funkční genomika - metody přímé a reverzní genetiky, editace genomu pomocí syntetických nukleáz, identifikace regulačních sekvencí. Genomové projekty prokaryot, rostlin, živočichů a člověka.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
|
Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Metody práce s textem (učebnicí, knihou)
|
|
Výstupy z učení
|
Seznámení s moderními metodami studia genomů a náplní genomových projektů.
Student bude schopen - vysvětlit a použít moderní techniky pro studium genomů - orientovat se v problematice a vést vědeckou diskusi v širších souvislostech celého oboru
|
|
Předpoklady
|
nespecifikováno
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Ústní zkouška
Zkouška v rozsahu probíraného učiva.
|
|
Doporučená literatura
|
-
Birren et al. (1997). Genome analysis - Mapping Genomes. New York.
-
Gibson, G., Muse, V.S. (2004). A Primer of Genome Science. Sunderland.
-
Kole, Ch., Abbot, A.G. (2008). Principles and Practices of Plant Genomics. Enfield.
-
Meksem, K., Kahl, G. (2005). The Handbook of Plant Genome Mapping. Weinheim.
-
Šmarda et al. (2005). Metody molekulární biologie. Brno.
|