Předmět: Molekulární fytopatologie

» Seznam fakult » PRF » KBB
Název předmětu Molekulární fytopatologie
Kód předmětu KBB/PGB4F
Organizační forma výuky Přednáška
Úroveň předmětu Doktorský
Rok studia nespecifikován
Semestr Zimní a letní
Počet ECTS kreditů 5
Vyučovací jazyk Čeština, Angličtina
Statut předmětu nespecifikováno
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Navrátil Milan, prof. RNDr. CSc.
Obsah předmětu
Fytopatogenní mikroorganizmy: viry, viroidy, bakterie a houby, jejich biologická charakteristika. Mechanizmy vzniku genetické variability mikroorganizmů. Molekulární taxonomie mikroorganismů. Proces infekce hostitele na buněčné a molekulární úrovni. Genetika interakcí hostitel-patogen (geny avirulence a rezistence). Mechanizmy specifické rezistence, indukované rezistence a nehostitelské rezistence (imunita, rezistence, náchylnost, tolerance, citlivost, hypersenzitivita). Molekulární determinanty patogenity a mechanizmy jejich účinku (toxiny, enzymy, fytohormony, přímá interakce s DNA hostitele). Mechanizmy spuštění obranných reakcí rostlin (elicitory, receptory, přenašeče signálu, získaná systémová rezistence, indukovaná systémová rezistence). Mechanizmy patogenů potlačující obranu hostitele. Umlčování genů: principy a aplikace, transgenní rostliny a indukovaná rezistence. Aplikace metod funkční genomiky, klasické a reverzní genetiky při studiu interakcí rostlina-patogen. Metody molekulární diagnostiky patogenů. Mikrobiomy a jejich analýza pomocí PCR a sekvenování nové generace.

Studijní aktivity a metody výuky
Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Metody práce s textem (učebnicí, knihou)
Výstupy z učení
Cílem předmětu je seznámit studenty s biologií, genetikou a biochemií interakcí rostlina-patogen; seznámit je s vybranými molekulárně-genetickými metodami studia mikroorganismů.
Student bude po absolvování předmětu schopen: - charakterizovat fytopatogenní mikroorganizmy - vysvětlit genetické aspekty interakcí rostlina-patogen - vysvětlit úlohu molekulárních determinant v průběhu patogeneze - popsat úlohu obranných mechanizmů rostlin v průběhu patogeneze - aplikovat moderní molekulárně genetické metody při studiu diversity mikroorganismů - aplikovat moderní molekulárně genetické metody při studiu interakcí rostlina-patogen - diskutovat o interakcích rostlina-patogen
Předpoklady
nespecifikováno

Hodnoticí metody a kritéria
Ústní zkouška

Doktorandská zkouška v rozsahu obsahu.
Doporučená literatura
  • Agrios, G. N. (2005). Plant Pathology. Elsevier, Academic Press, New York.
  • Crute, I.R., Holub, E.B., Burdon, J.J. (Eds.). (1997). The gene-for-gene relationship in plant-parasite interactions. CAB International.
  • Dickinson, M. (2003). Molecular plant pathology. School of Biosciences, University of Nottingham, BIOS Scientific Publishers.
  • Dyakov, Y., Dzhavakhiya, V., Korpela, T. (Eds). (2007). Comprehensive and Molecular Phytopathology.. Elsevier Science.
  • Kůdela, V. a kol. (1989). Obecná fytopatologie. Academia Praha.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr