Vyučující
|
-
Vrzalová Aneta, Mgr. Ph.D.
-
Nádvorník Petr, RNDr. Ph.D.
|
Obsah předmětu
|
Techniky izolace a purifikace nukleových kyselin, stanovení jejich koncentrace a kvality. Gelová elektroforéza nukleových kyselin. Enzymy používané v molekulární biologii (polymerázy, nukleázy, ligázy, fosfatázy, kinázy, metylázy). Hybridizace nukleových kyselin, hybridizační sondy. Polymerázová řetězová reakce (PCR, RT-PCR), kvantitativní PCR (qPCR, qRT-PCR) jejich chemismy a hodnocení. Sangerovo a NGS sekvenování. Klonování DNA, klonovací a expresní vektory, transkripce in vitro, translace in vivo. Cílená mutageneze. Stanovení interakcí protein-protein, nukleová kyselina-protein. Molekulární metody studia genetické variability organismů a jejich populací (RFLP, AFLP, RAPD, detekce SNP, SSCP, mikrosatelitová DNA).
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming)
|
Výstupy z učení
|
Seznámit studenty s teoretickým základem, provedením, hodnocením a využitím moderních metod molekulární biologie a genetiky. Důraz je kladen na schopnost studenta zvolit vhodné postupy a metody při plánovaní a realizaci experimentů.
Po absolvování zkoušky je student schopen: - popsat a vysvětlit postupy moderních metod molekulární biologie a jejich aplikace - vybrat z katalogů vhodné reagencie, přístroje a laboratorní vybavení pro realizaci molekulárně-biologického experimentu - vypočítat podle vstupních parametrů množství a koncentrace reagencií pro reakční směsi, případně stanovení fyzikálně-chemických parametrů reakcí (PCR, enzymatické a hybridizační reakce, izolace a značení nukleových kyselin, centrifugace) - vyhodnotit data získaná měřeními a umět je interpretovat (kvantitativní PCR, koncentrace a čistota nukleových kyselin)
|
Předpoklady
|
nespecifikováno
KBB/MBIO1
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Ústní zkouška
Ústní zkouška v rozsahu probírané látky a hodnocení experimentálních dat v rozsahu probírané látky, 2 náhodně vybrané otázky, hodnocení experimentální dat, práce s informačními zdroji.
|
Doporučená literatura
|
-
Brown T.A. (2008). Klonování genů a analýza DNA. Nakladatelství UP Olomouc.
-
Šmarda, J., Doškař, J., Pantůček, R., Růžičková, V., & Koptíková, J. (2005). Metody molekulární biologie. Brno: Masarykova univerzita.
-
Turňa I., Stuchlík S., Drahovská H., Gálová Z., Timko J. (2004). Techniky rekombinantních DNA. Veda.
|