|
Vyučující
|
-
Doležel Jaroslav, prof. Ing. DrSc.
|
|
Obsah předmětu
|
Klasifikace cytometrických technik, cytomika. Průtoková cytometrie, historie, parametry měřitelné pomocí průtokové cytometrie, základní části průtokového cytometru. Fluidika, laminární proudění, průtoková komůrka, hydrodynamická fokusace. Třídění pomocí cytometru a používaná konstrukční řešení, aplikace třídění pomocí cytometrie. Zdroje světla, rtuťové výbojky a lasery, optické filtry. Detekce světelných pulzů, fotodiody a fotonásobiče, parametry světelného pulzu. Zesilovače signálu, digitální zpracování signálů, kompenzace fluorescence, typy zobrazení výsledků analýzy. Aplikace průtokové cytometrie u rostlin, analýza a třídění mitotických chromozómů, analýza protoplastů, analýza chloroplastů, analýza genové exprese, studium fytoplanktonu, fytopatologie, technologie Luminex. Analýza obsahu jaderné DNA, stanovení ploidie, určení velikost jaderného genomu, identifikace mezidruhových hybridů, detekce aneuploidie, určení způsobu reprodukce, analýza kinetiky buněčného cyklu, apoptóza, endoreduplikace, třídění buněčných jader. Využití cytometrie biomedicínském výzkumu, imunofenotypizace, CD nomenklatura, mitochondrie a apoptóza, membránový potenciál mitochondrií, fluorescenční přenos energie (FRET).
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
|
Přednášení, Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming)
|
|
Výstupy z učení
|
Přehled cytometrických metod, jejich principy a jejich využití v rostlinné genetice a biomedicinském výzkumu.
Po absolvování kurzu je student schopen: - Vysvětlit princip průtokové cytometrie. - Popsat funkce jednotlivých součástí přístroje. - Aplikovat průtokovou cytometrii v rostlinném výzkumu. - Diskutovat využití průtokové cytometrie v medicíně a klinické praxi. - Zhodnotit užitečnost této metody k řešení vybraných problémů. - Interpretovat data získaná průtokovou cytometrií. - Zhodnotit kriticky vědecké články.
|
|
Předpoklady
|
nespecifikováno
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Ústní zkouška
75% účast na přednáškách, ústní kolokvium
|
|
Doporučená literatura
|
-
Darzynkiewicz, Z., Crissman, H.A. (1990). Methods In Cell Biology: Flow Cytometry. Academic Press, San Diego.
-
DARZYNKIEWICZ, Z., CRISSMAN, H.A., ROBINSON, J.P. (2000). Methods in Cell Biology: Cytometry, 3rd Edition. Academic Press, San Diego.
-
DOLEŽEL, J., GREILHUBER, J., SUDA, J. (2007). Cytometry with Plant Cells. Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim.
-
Eckschlager, T. a kolektiv. (1999). Průtoková cytometrie v klinické praxi. Grada Publishing, Praha.
-
Robinson, J.P., Darzynkiewicz, Z. (1997). Current Protocols in Cytometry. John Wiley & Sons, New York.
-
Shapiro, H.M. (2003). Practical Flow Cytometry, 4th Edition. John Wiley and Sons, Inc., New York.
|