|
Vyučující
|
-
Doležel Jaroslav, prof. Ing. DrSc.
|
|
Obsah předmětu
|
Předmět studia, chromozomální teorie dědičnosti, DNA jako nositelka dědičné informace, struktura DNA, genetický kód, genom eukaryot a prokaryot, velikost genomu, typy sekvencí DNA v genomu Strukturní geny a geny kódující funkční RNA, transkripce, introny a exony, původ intronů, alternativní sestřih, repetitivní sekvence DNA, biologický význam repetitivních sekvencí a jejich patogenicita. Genom prokaryot, eubakterie a archebakterie, příklady sekvenovaných prokaryot. Genom eukaryot, genomy mitochondrií a plastidů, buněčné jádro, chromatin, chromozomální domény, uspořádání chromozómů v jádře, jaderná tělíska, místa replikace DNA. Histonový kód, změny kondenzace chromatinu a regulace genové exprese, umlčování retroelementů, role RNA interference, genomické izolátory. Funkční domény chromozómů, centroméra, neocentroméra, sekundární konstrikce, nukleolární dominance, teloméra, vznik nové teloméry. Pohlavní chromozómy, evoluce pohlavních chromozómů, regulace dávky genů, B chromozómy, imprinting. Izochory, uspořádání genů v genomu, genové ostrovy a pouště, konzervované nekódující sekvence DNA, distribuce repetitivní DNA v genomu, stabilita a variabilita genomů. Evoluce genomů, kolinearita a syntenie, evoluce genovou duplikací, paralogní a ortologní geny, polyploidizace, mezidruhová hybridizace, evoluce repetitivních sekvencí DNA. Poznatky získané sekvenování celých genomů živočichů a rostlin.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
|
Přednášení, Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming)
|
|
Výstupy z učení
|
Genomy prokaryot a eukaryt a jejich struktura, organizace a analýza. Genomika a funkční genomika. Evoluce a fylogenetická analýza na úrovni genomu.
Po absolvování kurzu je student schopen: - Popsat strukturu prokaryotického a eukaryotického genomu. - Popsat strukturu genu, nekódující DNA, a jejich evoluci - Zhodnotit důsledky genomové duplikace a aktivity repetitivní DNA. - Definovat organizaci buněčného jádra a jeho funkci. - Vysvětlit molekulární strukturu funkčních chromozómových domén. - Vysvětlit podstatu epigenetické regulace genů a roli struktury chromatinu - Zhodnotit kriticky vědecké články.
|
|
Předpoklady
|
nespecifikováno
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Písemná zkouška
Pisemny test, 75% spravne odpovezenych otazek
|
|
Doporučená literatura
|
-
Alberts, B., Bray, D., Johnson, A., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K., Walter, P. (2000). Základy buněčné biologie. Espero Publishing, Ústí nad Labem.
-
ALLIS ,C.D., JENUWEIN, T., REINBERG, D., CAPARROS, M.L. (2007). Epigenetics. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York.
-
Brown, T.A. Genomes. John Wiley and Sons, Inc., New York, 1999..
-
Gregory, T.R. (2005). The Evolution of the Genome. Elsevier, Amsterdam.
-
Leitch, I. J., Greilhuber, J., Doležal, J., & Wendel, J. F. (2013). Plant genome diversity. Wien: Springer.
-
Lewin, B. (2000). Genes VII.. Oxford University Press, Oxford.
-
Lynch, M. (2007). The Origins of Genome Architecture. Sinauer Associates. Inc. Publishers, Sunderland.
-
Snustad, D.P., Simmons, M.J. (2009). Genetika. Masarykova Univerzita, Brno.
|