|
Vyučující
|
-
Šipoš Jan, Mgr.
-
Kuras Tomáš, RNDr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
1-2. Seznámení se s webovými stránkami a programem R, popis konzoly, úvod do syntaxe. 3-4. Práce s knihovnami a blíčky 5-6.Tvoření jednoduchých příkazů, objektů v R 7-8. Tvorba funkcí v programu R. 9-10. Aplikování základních metod popisné statistiky na konkrétní data. 11-12. Úvod do tvorby grafů v prostředí R. 13-14. Možnosti použití základních regresních metod v prostředí R.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
|
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Demonstrace
|
|
Výstupy z učení
|
Cílem předmětu je seznámit studenty s novým statistickým programem a naučit je tento program samostatně používát. Statistický software R je "open source" program je tedy volně dostupný a šiřitelný. Studenti ziskají přehled o webových stránkách, kde se dá program stáhnout, budou schopni používat nápovědu a jinou dokumentaci umístěnou na této stránce. Méně přátelské rozhraní programu R, tj. zadávání příkazů přes konzolu R bude vyžadovat znalost syntaxe jazyka. Možnosti programu R pro potřeby analýzy biologických dat jsou obrovské, stále jsou pro tento program vymýšleny nové metody analýzy dat a jsou vytvářeny soubory knihoven a doplňujících balíčků pro jednotlivé vědní disciplíny (např. Vegan pro ekologii, Bioconductor pro bioinformatiku, Rgeo pro geografii, ade4 pro zpracování mnohorozměrných dat, ape pro taxonomické analýzy). Jendním z cílů proto bude naučit studenty jak prácovat s různými balíčky, které může daný program využívat. Program R je především vhodný pro moderní statistické analýzy, proto hlavní pozornost semináře bude věnovaná aplikaci těchto statistických metod na konkrétních datech.
- orientace a znalost syntaxe v prostředí R - dovednost samostatně používat statistické analýzy v programu R - využívání moderních statistických metod v programu R - schopnost samostatného nastudování a používání nových statistických metod
|
|
Předpoklady
|
- znalost základních statistických metod - znalost práce s tabulkamy v programu Microsoft Excel - povědomí o obecných statistických principech - ochota se učit syntaxi daného programu
BOT/BSTSB
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Písemná zkouška
- aktivní účast na seminářích - vypracování samostatného úkolu
|
|
Doporučená literatura
|
-
Crawley M.J., Hoboken N.J. (2007). The R book. Wiley..
-
Drozd P. (2007). Cvičení z biostatistiky. Základy práce ze softwarem R. Universitas Ostraviensis. ISBN 978-80-7368-433-4.
-
Faraway J.J. (2004). Linear Models with R. Chapman & Hall, New York..
-
Faraway J.J. (2005). Extending the Linear Model with R: Generalized Linear, Mixed Effects and Nonparametric Regression Models (Texts in Statistical Science). Chapman & Hall, New York..
-
Pekár S., Brabec M. (2009). Moderní analýza biologických dat. Scientia, Praha. ISBN 978-80-86960-44-9.
-
Wood S. (2006). Generalized Additive Models: An Introduction with R (Texts in Statistical Scence). Chapman & Hall, New York..
|