Předmět: Biosémiotika

» Seznam fakult » FIF » KOL
Název předmětu Biosémiotika
Kód předmětu KOL/VBS
Organizační forma výuky Přednáška + Seminář
Úroveň předmětu Bakalářský
Rok studia nespecifikován
Semestr Zimní a letní
Počet ECTS kreditů 4
Vyučovací jazyk Čeština, Angličtina
Statut předmětu Povinně-volitelný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Dostupnost předmětu Předmět je nabízen přijíždějícím studentům
Vyučující
  • Zámečník Hadwiger Lukáš, Mgr. Ph.D.
  • Rodríguez Higuera Claudio, Ph.D., M.A.
  • Faltýnek Dan, doc. Mgr. Ph.D.
Obsah předmětu
(1) Historie vztahů lingvistiky a biologie ? metafory a metody (na příkladu historicko-srovnávací jazykovědy a teorie Pražského lingvistického kroužku) ? Schleicher, A.: Darwinism Tested by the Science of Language. London: J. C. Hotten 1969. ? Rádl, E.: Dějiny biologických teorií novověku. Praha: Academia 2006. ? Berg, S. L.: Nomogenesis or evolution determined by law. London: Constable 1926. (2) Umwelt ? předzvěst biosémiotiky ? von Uexküll, J.: Nauka o významu. In: Kliková, A. ? Kleisner, K.: Umwelt. Koncepce živého světa Jakoba von Uexkülla. Červený Kostelec: Pavel Mervart 2006, s. 13?69. (3) Quest for the essence of language ? počátky jazykové metafory života a Roman Jakobson ? Jakobson, R.: Linguistics in Relation to Other Sciences. In: Selected Writings II. Word and Language. The Hague: Mounton 1971, s. 655?696. ? Katz, G.: The Hypothesis of a Genetic Protolanguage: An Epistemological Investigation. Biosemiotics, 2008, 1, s. 57?73. (4) The language of genes ? metafory a metody, jazykovost DNA v současných perspektivách ? Searls, D. B.: The Language of Genes. Nature, 2002, sv. 420, s. 211?217. ? Raible, W.: Linguistics and Genetics: Systematic Parallels. In: Haspelmath, M. ? König, E. ? Oesterreicher, W. ? Raible, W. (eds): Language Typology and Language Universals. AnInternational Handbook. Berlin ? New York: Walter de Gruyter 2001, s. 103?123. (5) Markoš ? tajemství hladiny a tajemství DNA ? Markoš, A.: Tajemství hladiny. Praha: Dokořán 2003. / Markoš, A.: Readers of the Book of Life: Contextualizing Developmental Evolutionary Biology. New York: Oxford University Press 2002. ? Markoš, A.: Do Biosemiotics, But Don?t Forget Semiosis. Biosemiotics, 2009, sv. 2, č. 1, s. 117?119. ? Markoš. A. ? Grygar, F. ? Hajnal, L. ? Kleisner, K. ? Kratochvíl, Z. ? Neubauer, Z.: Life as Its Own Designer: Darwin?s Origin and Western Thought. Springer 2009. (6) Barbieri ? organické kódy ? Barbieri, M.: Organické kódy. Praha: Academia 2006. (7) Trifonov ? překrývající se kódy DNA ? Trifonov, E. N.: The Multiple Codes of Nukleotide Sequences. Bulletin of Mathematical Biology, 1989, sv. 51, č., 4. s. 417?432. ? Trifonov, E. N. ? Kirzhner, A. ? Kirzhner, V. M. ? Berezovsky, I. N.: Distinct Stages of Protein Evolution as Suggested by Protein Sequence Analysis. J. Mol. Evol., 2001, sv. 53, s. 394?401. ? Trifonov, E. N., Berezovsky, I. N.: Proteomic Code. Molecular Biology, 2002, sv. 36, s. 239? 243. (8) Ji ? jazykové plány buňky ? Ji, S.: Isomorphism between Cell and Human Languages: Molecular Biological, Bioinformatic and Linguistic Implications. Biosystems, 1997, roč. 44, č. 1, s. 17?39. ? Ji, S.: The Linguistics of DNA: Words, Sentences, Grammar, Phonetics, and Semantics. Molecular Strategies in Biological Evolution. Annals of the New York Academy of Science, 1999, sv. 870, s. 411?417. (9) Pattee ? autoreprodukce, fyzikální a sémiotické

Studijní aktivity a metody výuky
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Metody práce s textem (učebnicí, knihou)
Výstupy z učení
Seminář základním způsobem uvádí do historie a současného stavu biosémiotiky. Témata seminářů představují vybrané biosémiotické školy, teorie či přístupy a výběrově přední představitele biosémiotiky. Účastníci jsou nejdříve seznámeni s nejnutnějšími základy molekulární biologie, které jsou výchozí pro vysvětlení sémiotického statusu DNA a proteosyntézy. Důraz je následně kladen na současný sémiotický popis proteosyntézy. Seminář především testuje regulérnost sémiotického pojímání proteosyntézy, DNA, procesů v živém tvaru atd., definuje předpoklady gramatického popisu proteosyntézy. Úkolem semináře je analyzovat konkrétní texty jednotlivých autorů a podrobovat je kritice z hlediska sémiotického a lingvistického. Na základě určení výrazové a obsahové sady v konceptech analyzovaných textů a užití komutačního testu je postupně formulován udržitelný sémiotický výklad DNA a proteosyntézy. Seminář ve výsledku určí arbitrární rozhraní výrazové a obsahové sady sémiózy DNA a proteosyntézy, formuluje koncept dvojí artikulace projevující se ve struktuře výrazové sady a řeší problematiku nalezení metajazyka vhodného k popisu obsahové sady. Pozornost kurzu je věnována také lingvistickým a lexikostatistickým metodám při analýze textu i DNA/proteosyntézy, charakteristikám jazyka/textu/DNA/proteosyntézy apod. ve vztahu k teorii informace a komunikace ? jazyku a živému tvaru jakožto systémům optimalizovaným pro přenos informace.
Základní orientace v otázkách biosémiotiky Schopnost formulovat problémové oblasti biosémiotiky a předložit základní směry jejich řešení Schopnost znakové charakteristiky proteosyntézy Schopnost kritiky znakových konceptů biosémiotiky
Předpoklady
Základní znalost angličtiny

Hodnoticí metody a kritéria
Analýza výkonů studenta, Rozhovor, Systematické pozorování studenta, Rozbor portfolia studenta

(1) aktivita v semináři (četba jednoho z doporučených textů/jeho části na každý seminář ? diskuse) (2) úspěšné absolvování kolokvia
Doporučená literatura
  • Alberts, B. ? Bray, D. ? Johnson, A. ? Lewis, J. ? Raff, M. ? Roberts, K. ? Walter, P. (2005). Základy buněčné biologie. Praha.
  • Barbieri, M. Organické kódy. Praha 2006.
  • Favareau, D. (ed.). (2010). Essential Readings in Biosemiotics: Anthology and Commentary. Berlin.
  • Markoš, A. (2003). Tajemství hladiny: hermeneutika živého. Praha: Dokořán.
  • Nöth, W. (1995). Handbook of semiotics. Bloomington.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Filozofická fakulta Studijní plán (Verze): Obecná lingvistika a teorie komunikace maior pro Lingvistiku a Digital Humanities (2021) Kategorie: Filologické vědy 1 Doporučený ročník:1, Doporučený semestr: -
Fakulta: Filozofická fakulta Studijní plán (Verze): Obecná lingvistika a teorie komunikace maior (2019) Kategorie: Filologické vědy 1 Doporučený ročník:1, Doporučený semestr: -
Fakulta: Filozofická fakulta Studijní plán (Verze): Lingvistika a Digital Humanities maior pro Obecnou lingvistiku a teorii komunikace (2020) Kategorie: Filologické vědy - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: -
Fakulta: Filozofická fakulta Studijní plán (Verze): Obecná lingvistika a teorie komunikace minor (2019) Kategorie: Filologické vědy 1 Doporučený ročník:1, Doporučený semestr: -
Fakulta: Filozofická fakulta Studijní plán (Verze): Lingvistika a Digital Humanities (2020) Kategorie: Filologické vědy - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: -
Fakulta: Filozofická fakulta Studijní plán (Verze): Obecná lingvistika a teorie komunikace (2014) Kategorie: Filologické vědy - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: -
Fakulta: Filozofická fakulta Studijní plán (Verze): Obecná lingvistika (2021) Kategorie: Filologické vědy - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: -
Fakulta: Filozofická fakulta Studijní plán (Verze): Lingvistika a Digital Humanities minor pro Obecnou lingvistiku a teorii komunikace (2020) Kategorie: Filologické vědy - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: -
Fakulta: Filozofická fakulta Studijní plán (Verze): Obecná lingvistika minor (2022) Kategorie: Filologické vědy - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: -
Fakulta: Filozofická fakulta Studijní plán (Verze): Lingvistika a Digital Humanities maior (2020) Kategorie: Filologické vědy - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: -
Fakulta: Filozofická fakulta Studijní plán (Verze): Lingvistika a Digital Humanities minor (2020) Kategorie: Filologické vědy - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: -
Fakulta: Filozofická fakulta Studijní plán (Verze): Obecná lingvistika a teorie komunikace minor pro Lingvistiku a Digital Humanities (2021) Kategorie: Filologické vědy 1 Doporučený ročník:1, Doporučený semestr: -
Fakulta: Filozofická fakulta Studijní plán (Verze): Obecná lingvistika maior (2019) Kategorie: Filologické vědy - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: -