Předmět: Lingvistika DNA 1

» Seznam fakult » FIF » KOL
Název předmětu Lingvistika DNA 1
Kód předmětu KOL/91PL1
Organizační forma výuky Seminář
Úroveň předmětu Doktorský
Rok studia nespecifikován
Semestr Zimní a letní
Počet ECTS kreditů 15
Vyučovací jazyk Čeština
Statut předmětu Povinně-volitelný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Matlach Vladimír, Mgr. Ph.D.
Obsah předmětu
Podrobnější výklad o několika nejvýznamnějších přístupech moderní formální lingvistiky, a to chomskyanského GB a minimalismu, lexikální funkční gramatiky J. Bresnanové, teorie optimalismu, kategoriální gramatiky a různých přístupech gramatiky závislostní. V celém výkladu bude brán výrazný zřetel na strukturální lingvistiku Pražské školy a její výsledky.

Studijní aktivity a metody výuky
Přednášení
Výstupy z učení
Seminář základním způsobem představí využití lingvistických metod v biologii. Z hlediska těchto metod se jedná o tradiční způsoby analýzy textu, které mohou pocházet z odlišných vědních oborů, ale souvisejí s dlouhodobě prováděným výzkumem textů přirozeného jazyka a s hypotézami, které se k projevům, vztahujícím se k danému typu analýzy, vysvětlují z hlediska povahy přirozeného jazyka, jeho univerzáliím, nebo povah textu, ekonomizačním principům projevujícím se v jeho struktuře, synergetickým efektům (viz Köhler, Zámečník). Na začátku seminář představí historické kořeny analogizování DNA a přirozeného jazyka (Crick) a vznik jednotlivých analogií struktury obou kódů - především v případě R. Jakobsona. Následně se témata zaměří na ověřování jednotlivých projevů textů přirozeného jazyka v genetickém textu a na hypotézy s tím spojené. V prvním případě se jedná o tematiku komplexity genetického kódu. Následně bude věnována pozornost projevům lingvistických zákonů v textech genetických - Zipfův zákon, Menzerath-Altmannův zákon. Ve všech případech budou posluchači instruováni k samostatnému provedení analýz na vlastních vzorcích genetického textu. Témata seminářů: Prvotní zavedení genetického kódu a jeho základní vlastnosti Jakobsonova analogie DNA a jazyka; vztahy jazykových plánů a DNA, RNA, proteinů Entropie textu přirozeného jazyka a DNA; náhodný text, DNA a přirozený jazyk Zipfův zákon; předpovědi funkce junk-DNA a vysvětlení projevů Menzerath-Altmannův zákon; fraktálnost genetického textu Metody rekonstrukce vzniku a rozvoje genetického kódu Proteinová struktura a vztahy primární a sekundární struktury proteinů Možnosti identifikace struktury kódu mapování projevů lingvistických zákonů Taxonomické metody - Bag-of-words; Demerau-Levenstein Synergetický přístup k proteosyntéze; synergetická lingvistika v aplikaci na analýzu genetického textu

Předpoklady
Předmět je určen pouze pro studenty doktorského studia.

Hodnoticí metody a kritéria
Ústní zkouška

Literatura, účast na přednášce, rešerše. Výuka se bude konat 14. 6. 2013.
Doporučená literatura
  • Hajičová, Panevová, Sgall. (2003). Úvod do teoretické a počítačové lingvistiky. Praha.
  • Sells, P. (1985). Lectures on Contemporary Syntactic Theories. Stanford.
  • Stockwell, R. M. (1977). Fundations of Syntactic Theory. New Persey.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Filozofická fakulta Studijní plán (Verze): Lingvistika a Digital Humanities (2020) Kategorie: Filologické vědy - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: -
Fakulta: Filozofická fakulta Studijní plán (Verze): Lingvistika a Digital Humanities (2020) Kategorie: Filologické vědy - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: -